就在阮元南返的同时，九月十八日，嘉庆一行也回到了京城。乘舆刚刚入京，嘉庆便即发出诏令，要求所有王公重臣，一律前往丰泽园听候旨意。午未之交，丰泽园内已是群臣毕集。嘉庆设了御案，居中升坐，令左右取了诏书上来。董诰随即出班，向下宣读诏书。
这时，王公大臣们方才清楚，嘉庆此诏乃是一篇罪己诏：
朕绍承大统，不敢暇逸，不敢为虐民之事。自川、楚教匪平后，方期与吾民共享承平之福，乃昨九月十五日，大内突有非常之事。汉、唐、宋、明之所未有，朕实恧焉。然变起一朝，祸积有素。当今大患，惟在因循怠玩。虽经再三诰诫，舌敝笔秃，终不足以动诸臣之听，朕惟返躬修省耳。诸臣原为忠良，即尽心力，匡朕之咎，正民之志，切勿依前尸位，益增朕失。通谕知之。
可是诏书尚未读完，下面大臣之中，便即出现了议论之语。
“礼亲王，你说皇上这罪己诏，所罪何事啊？”
“唉，这件事说起来，皇上又有何罪啊？所谓罪己，其实还是在咱们身上啊。如此罪己诏，又怎能让天下信服啊？”
所幸嘉庆并没有听到这些议论之音，直到董诰读完诏书，重新回归朝臣之中，嘉庆方才开了口，道：“九月十五的事，你等当时有在场的，也有不在场的，但如今应该都清楚了吧？光天化日之下，宫禁之前，贼人不过七十七人，竟然丧心病狂，视重重宫卫如无物！如此行径，对我君臣而言，简直就是奇耻大辱！朕也知道，前日之事，若是朕不能给你等一个结果，这禁门之变，不仅仅在前日，它还在明日、后日！朕是天子，出了这样的事，朕自当受首过，是以朕斟酌了两日一夜，作了这篇罪己诏宣示于此。除此之外，朕也再行宣谕嘉庆四年，朕亲政伊始所颁上谕，群臣吏民，若有知国之弊政，有更革之法者，尽可直言无隐！只是朕想着，朕虽有过，可平日累次责令你等，凡事不可因循疲玩，太平之世，亦当修武备，可你们在做什么，为什么朕几次三番严词训谕，可在你们之中有些人的眼里，朕这些话，就只是儿戏吗？！”
“皇上，臣等有罪，臣等有罪啊！”听着嘉庆严厉斥责，庆桂、董诰、勒保、刘权之四名大学士也当即出班道。各人也都清楚，这次嘉庆是要决意肃清官场，皇帝之下，便是宰相，既然嘉庆已经下了罪己诏，下一步自然是要针对自己了，与其被嘉庆严厉责罚，倒不如抢先认错，便相继向嘉庆谢罪。
“你等大学士有罪？你等又有何罪啊？”果然，嘉庆对于四名大学士，并没有继续严惩之意，而是喟然长叹道：“你等其实无罪，而且，你等的功劳，朕也还记得啊。庆桂、董诰，你二人前后入值军机二十余年，外面称你二人一句枢臣，朕觉得不为过。勒保川楚之役，便有大功，刘权之勤勉政事，亦有多年，如今之事，你们说自己有罪，你们罪在何处呢？可是……”说到这里，嘉庆却话锋一转，道：“你们的功勋，终究也是你们之前所建，如今朕看着你们，心中也是怜惜你等啊，你们都是快要八十岁的人了，须发之间，哪里还有一丝黑须，一片黑发呢？你们为大清效力了一辈子，朕不能恩将仇报啊？可那么多年轻人也看着呢，你们是自己觉得精力不减当年，这宰辅之职，你们还能干下去，可你们如今的精力，真的还比得上当年吗？下面的人呢？他们眼看带领之人，俱是古稀长者，他们还会有太祖太宗之时那样的锐气吗？所以朕想着，你等为这个朝廷，已经做得够多了，接下来，你们也到了安享清福的时候了啊。传旨，一等伯、大学士勒保，太保、大学士庆桂，大学士刘权之，协办大学士邹炳泰，俱令休致！大学士、军机大臣董诰，精力尚足，着……三日一入军机处吧。”
“臣等谢皇上厚恩，臣等情愿致仕，归家颐养天年！”庆桂、勒保、刘权之、邹炳泰四人自然清楚，嘉庆能够对自己不加责罚，只是强令自己退隐，已是最大的宽容，便也当即接受了嘉庆的决定。果然，三年之后，庆桂去世，终年八十，赐谥文恪。五年之后，刘权之在家病故，同终年八十，谥文恪。六年后，勒保过世，年八十一，加一等侯并赐谥文襄，邹炳泰亦卒于嘉庆二十五年。四人致仕之后，嘉庆俱使之善终。
“好了，你们先回去吧。”嘉庆对几名大学士议决完毕，也终于开始了真正的严惩，对群臣道：“方才朕让他们几人致仕，是因为之前数十年，他们四人一直尽心国事，勤勉任职，而此禁门之变，他们俱在行在，本也不能直接调度京中禁军。所以朕给他们这个机会，让他们如此终老余年。但你等之中，有多少人直接涉及禁门之事，你们心里应该清楚！接下来，朕一个个问你们，英和，前九门提督吉纶何在？带上来！”
“回皇上，吉纶带到！”英和入京之后，便已软禁了吉纶，这时自然遵奉嘉庆之旨，呼着两名步军统领衙门的卫兵，将吉纶押了上来。
“吉纶，朕让英和整顿步军统领衙门，其中之事，朕已经清楚，九月十五当日，上午就有十余百姓，前来向你告知京城多处城门，皆有行踪诡异之人，当时你若是及时发兵剿捕，他们根本到不了宫禁之内！朕也想听你解释一下，事发之时，你在那里想什么呢？”
“皇上，这……”吉纶眼看嘉庆已是箭在弦上，哪里还敢对嘉庆再行辩解？只得以头抢地，道：“是奴才糊涂了，奴才当时想着天下承平日久，绝不会有奸人如此大胆，竟然公开犯禁，是以奴才当时没有发兵……皇上，奴才该死，奴才该死啊！”
“承平日久？七十七个贼人，视宫禁重地如无物，这就是你堂堂九门提督，给朕的承平日久吗？！”嘉庆终于按捺不住，对吉纶大骂道：“你不要以为朕不知道！你在山东的时候，就有人说你为人庸碌，不堪治事，当时朕遣人去过山东，没有实据，所以朕对你才没问罪，还让你进京做了九门提督，如今看来，是朕瞎了眼了！吉纶，朕知道，当年和珅伏法，你是有功之人，所以朕对你格外信用，山东巡抚、九门提督，哪一个不是要职？可你都做了什么？！你以为你凭着之前的功劳，就可以无所事事，混迹官场了吗？朕也告诉你们，无论你们以前有无勋绩，今日失职，那今日朕便要严加惩处你等！吉纶，你有此大错，罪无可恕！英和听旨，明日便即查抄吉纶家产，若有贪贿之迹，直接论绞，朕绝不留情！西华门护军参领何在？出来！”
“皇上，奴……奴才哈宁阿见过皇上……”这时各人只见群臣之末，一个五品武官颤抖着走了出来，向嘉庆跪倒，不敢再发一语。
“将他顶子去了！”嘉庆盛怒之下，也顾不得再下诏旨，直接对身旁两名侍卫喝道。随即，嘉庆便对着哈宁阿大骂道：“你堂堂的五品参领，如何见了贼人，竟尚不如文人妾妇？！你可知道，贼人在文颖馆劫掠之时，好几个翰林手无寸铁，竟随手取了笔砚，与贼人殊死相抗，最后被贼人砍伤，他们也没后退！你倒好，整个西华门护军，在你这种酒囊饭袋指挥之下，眼看七十贼人，竟没动一刀一枪就让他们进了宫城，大清朝的颜面，都被你个丧尽天良的蠢货丢尽了！似你这种混账东西，朕再多看你一眼，朕都觉得恶心！传旨下去，九月十五日西华门所有护军，自哈宁阿以下，所有人一律开革，送往伊犁，终身在伊犁服役，永远不许回来！”
“皇上，奴才冤枉，奴才冤枉啊！”哈宁阿惊慌之下，竟想着若是继续检举揭发他人，说不定还有脱罪希望，当即辩道：“这……这都是……都是内监刘金干的！那日是刘金、是刘金突然从西华门外带了几十个人进来，说是为御膳房送菜，奴才一时糊涂，就信了他的鬼话，奴才实在不知道，那些人都是逆贼啊！”
“带刘金上来！”嘉庆怒道：“还有，这次禁门一事，所有牵连太监，刘得财、杨进忠、刘进亨，都带过来！”
一旁侍卫应声而去，很快，一众勾结天理教的太监便被捆成一排，带到了嘉庆御座之前。嘉庆也向刘金主动问道：“刘金，方才哈宁阿说，是你带了西华门的贼人进了宫城，这些贼人后面做了什么，朕不用再跟你讲一遍了吧？这样回想起来，你是恨朕入骨啊，你恨不得贼人那一日，就把这紫禁城拆了，你才解气，是也不是？！外面的人总是跟朕说，官 逼 民 反，你这样恨朕，也是平日朕待你不好了。可朕回想你这个人，你在宫禁之中职分不高，朕确实没有额外恩赏于你，可反过来说，朕也没有重责过你一次吧？朕没责罚过你，自然也不会冤枉你了。那朕现在不清楚了，朕究竟是哪一件事亏待了你啊？你给朕讲讲，若是朕错了，朕现在就向你认错，如何？”
“皇上，这……皇上没做什么对不起奴才的事啊？”刘金被嘉庆这样一问，却也老实，只想着刘得财、杨进忠等人反复对自己说起的“应劫”之语，便老老实实的向嘉庆说道：“可是，刘公公、杨公公他们告诉奴才，如今天下多灾，乃是天劫将至，只有九月十五送外面那些弟兄进宫，才能上应天劫，平安渡过末世啊？皇上，奴才只想渡劫，想着我大清天下，如此便能太平，哪里……哪里有什么悖逆之心啊？”
“你！如此无耻谰言，你竟然说得出来，尚无一丝悔改！”嘉庆万万没有想到，刘金乃是真心相信末世之语，二人这一番对话，竟是驴唇不对马嘴，盛怒之下，只认为刘金是执迷不悟，坚定地要和自己对抗到底，竟再也顾不得平日温润宽仁之态，当即对刘金等人喝道：“传朕旨意，宫中所有勾结匪逆之人，无论大小主从，一律凌迟处死！若尚有勾结外贼，尚不为我君臣所知者，一经查出，直接凌迟，朕绝不宽恕你等悖逆家奴！”
“皇上、皇上，奴才一向忠于皇上，一向忠于皇上啊！”刘金即便别的事再听不懂，“凌迟”是什么意思，自己却也清楚，一时之间，再也顾不得身边的王公百官，径自嚎哭起来，哭声之中，尽是绝望之情，许多两侧跪拜的大臣听了，也都心下恻然，或轻轻摇头，或闭上了眼睛，不忍再看刘金惨哭之状。
“皇上，小金子他……他是真的年幼糊涂啊。”听着刘金哭号，就连嘉庆身边的张进忠，这时也已经忍不住了，也从嘉庆一旁探了出来，向嘉庆跪倒，恳求道：“皇上，小金子奴才虽然不熟，却也清楚他底细，他入宫不过四年，入宫之前，在民间又不识文字，这何为忠义，何为荒诞，民间之人从来没有和他讲过啊？他入宫之后分在奴才这里，奴才便让刘得财和杨进忠管教于他，谁知……谁知他二人早已为外人所惑，竟也将小金子害了。可皇上，小金子他……他根本没有可能去记恨皇上啊？要不皇上就看在他四年来勤恳，外事又一概无知的份上，对他从轻发落吧？”