在众多外传剧情结束之后，《新机动战记高达w无尽的华尔兹》即将开启，之前获得5小强席位的5个公会各自获得了开启剧情的任务。除了这5个公会之外，另一只鸭子的吉恩公国和东方太阳公会分别负责杰古斯和预防者的任务。最新反派玛丽梅亚军则是由平民战线和铁雄公会组成。
首先是玛丽梅亚军的成立，玛丽梅亚军由巴顿财团创始人德基姆·巴顿建立，德基姆于A.c.196年扶持玛莉美亚·巴顿为傀儡，号称玛莉美亚是特列斯·克休里那达之女，发动了玛莉美亚之乱。
故事从平民战线绑架莉莉娜开始，第一纵解决了莉莉娜的守卫之后，强行带走了莉莉娜。与此同时卡托尔说服了除张五飞的其他5小强将自己的机体送到太阳销毁。
当众人得知莉莉娜被抓之后，希罗和迪奥迅速赶往玛丽梅亚军占据的殖民地x-探测战力，但是在他们行动之前张五飞和杜洛华就已经潜入了x-。张五飞因为不认同莉莉娜倡导的完全和平主义的社会，更无法接受将机体封印，于是便加入玛莉梅亚军，决心证明世界仍然需要战士。而杜洛华则是传统艺能，先假意加入对手收集情报，然后再作为内应打出关键一击。
这里开始有玩家介入，铁雄公会在殖民地x-外用里奥组成防线，沈静冉和燕飞云上驾驶穿梭艇进行突入，期间隶属预防者的东方太阳公会派出洛宸和陆枕帮沈静冉和燕飞云上缓解压力。
燕飞云上载着沈静冉面对大量敌机有些束手无策，邹琦在远处默默观察着，等待出手良机，这时候侧翼突然飞来两个导弹夹仓，直接在铁雄公会的阵型里炸开，大量导弹倾泄，导致现场混乱不堪。邹琦暗道一声不妙，迅速出手想要击溃燕飞云上的穿梭艇。
燕飞云上也不是傻瓜，直接油门踩到底，硬生生闯入了x-殖民地的港口，但是由于速度过快，直接来了个硬着陆。离开穿梭艇的时候，沈静冉还不忘打趣道：燕飞云上会长开穿梭艇的技术一般啊。
燕飞云上听的一头黑线，想要反驳的时候沈静冉已经没影了。
守在外面的邹琦没想到燕飞云上和沈静冉这么容易就杀进去了，脸上顿时有些挂不住，直接就去找在外面发射导弹的洛宸和陆枕。
洛宸和陆枕知道自己后面的戏份不多直接摆烂，连跑都不跑的和邹琦打了起来。
进入x-殖民地燕飞云上和沈静冉各自寻到了一台里奥之后就想进去捣乱，结果直接被大秦龙魂和鬼王潮逮个正着。
沈静冉有些懵懵的问大秦龙魂怎么找到自己的。大秦龙魂直接了当的回复：由系统任务给的地图标点。沈静冉顿时一头黑线，用里奥对战双头龙高达，她的任务难度直接拉满。
另一边鬼王潮根本没给燕飞云上说话的机会，上来就是一梭子子弹，巴顿财团的最新兵器mmS-01大毒蛇也正式亮相。
大毒蛇的设计灵感来源于重装高达，技术特点就是火力凶猛但是缺乏近战能力，燕飞云上想要接近鬼王潮用近战的方式解决战斗，只可惜里奥的性能不给力，两下就被击倒，失去了反抗能力。
沈静冉这边更加艰难，大秦龙魂用双发光束三叉戟轻松压制了沈静冉，沈静冉使出浑身解数也没能在大秦龙魂的手下支撑多久，被斩断双腿之后，直挺挺的倒在了地上。好在这一关有系统保护，一声声爆炸不断掩护着二人撤离，二人在丢弃了里奥之后，也顺利的在x-里潜伏了起来。
几人激烈交战的时候，杰古斯来到了预防者基地，表明了自己要加入预防者的决心，并获得新代号预防者-风。
此时的卡托尔正在和马格纳克队配合进行回收高达的任务，这个任务换算到玩家则是由维达公会来进行，这个任务考验的不再是玩家的机体操控水平，而是对角色自身的掌控力，由于难度较大，青花瓷费了大力气才勉强通过。
《新机动战记高达w无尽的华尔兹》的第一部分也告一段落。