。在石英联盟大赛夺冠后，小智带着荣耀与伙伴们踏上归乡路。阳光暖融融地洒在身上，皮卡丘在肩头欢快蹦跳，时不时瞅瞅路边随风摇曳的野花。同行的还有准天王中期实力的喷火龙，它威风凛凛地飞在小智一行人的头顶，时不时发出一声激昂的鸣叫，展示着冠军队伍的气势；准天王初期的水箭龟沉稳地跟在一旁，厚重的龟壳在阳光下闪烁着金属般的光泽；妙蛙花同样是准天王初期，它舒展着叶片，感受着微风，周身散发着生机勃勃的气息。
当路过热闹的小镇，集市里喧闹非凡，人们讨价还价、欢声笑语。突然，一只巨大快龙从天而降，稳稳落在小智面前，众人惊呼声此起彼伏。快龙背上的信筒吸引了小智注意，他好奇地取下信件，信封上只有宝可梦联盟的微光标志，没写寄件人。
小霞和小刚凑过来，满脸疑惑。小霞眨眨眼问：“小智，这谁寄的呀，这么神秘？”小刚摸着下巴分析：“能派快龙送信，这人不简单。”
小智打开信封，一张羊皮纸上写着：“致石英联盟大赛冠军小智，您的实力备受关注。诚邀您前往新岛，参加顶尖训练家的盛会。在这里，您能探索宝可梦的秘密，还有机会与传奇宝可梦并肩。请即刻启程，路线和详情随信附上。——神秘邀请者”
看到“传奇宝可梦”，小智眼睛放光，热血涌上心头。探索宝可梦世界、变强一直是他的梦想，这邀请简直是难得机遇。
林如雪在小智脑海中提醒：“小智，这事儿太奇怪，无故邀请还提传奇宝可梦，怕是有危险，别去了。”
但小智决心已定，眼神坚定：“林如雪，这可能是我成为宝可梦大师的重要机会，关乎宝可梦世界秘密，我不能错过。而且我相信我和宝可梦们能应对一切。”
小霞和小刚对视一眼，虽担心，但还是支持小智。他们按信中指示前往港口，准备乘船去新岛。
到港口时，天空突然乌云密布，狂风掀起巨浪拍打岸边。港口管理员波佳严肃地说：“今天风浪太大，出海太危险，所有船都停运。”
小智正着急，海男穿着奇异服饰走来，不屑地说：“胆小鬼，我不怕，我的暴鲤龙能带我过去。”说完放出暴鲤龙，骑上就朝新岛方向破浪而去。
空男和小甜也分别放出大比鸟和白海狮跟上。小智看着他们远去，急得直跺脚。
这时，一艘小船靠岸，船家穿着维京服饰，笑着说：“你们想去新岛吧？我可以带你们，不过要收报酬。”
小智等人犹豫一下，还是上了船。船在风浪里艰难前行，一个巨浪打来，船家竟是火箭队的武藏、小次郎和喵喵！武藏怪笑：“既然你们诚心诚意地发问了……”话没说完，又一个巨浪打翻小船，众人掉进海里。
“喷火龙，快出来！用喷射火焰稳住大家！”小智迅速喊道。喷火龙从精灵球里飞出，周身火焰熊熊，强大的气流阻挡着海浪。“水箭龟，使用水炮制造浮力！”水箭龟喷出强力水炮，借助反作用力让大家不至于下沉。“皮卡丘，十万伏特驱散周围的危险海洋宝可梦！”皮卡丘释放出电流，吓退了被风浪引来的恶系金鱼王。
历经艰险，他们终于登上新岛。岛上神秘安静，巨大树木遮天蔽日，偶尔传来未知宝可梦的叫声。一个像乔伊小姐的女子出现，面无表情地说：“跟我来，其他人到了。”
小智等人跟着她来到城堡前。推开门，海男、空男和小甜已在里面。突然灯光熄灭，超梦散发着紫色光芒缓缓降落，冰冷的声音响起：“欢迎来到我的领地，所谓的最强训练家们。接下来，你们将面临一场前所未有的考验 。”
林如雪的声音再度在小智脑海中响起，这次多了几分神秘与期待：“小智，要是有机会，要不要尝试收服一只超能系神兽？它或许能帮你应对接下来的挑战。” 与此同时，林如雪在心里暗自想道：“我已经知道，他是谁了。这超梦的出现绝非偶然，背后的秘密恐怕远超想象 。”