海底建筑的金属墙壁发出不堪重负的呻吟，裂缝中渗出的紫色流体在地面蜿蜒成诡异的图腾。林小羽攥着八音盒的手心里全是冷汗，零号项链的光芒忽明忽暗，仿佛随时都会熄灭。她望着莉莉亚所指的阴影处，那里的金属门正缓缓升起，露出一道散发着幽蓝光芒的缝隙 —— 门缝里飘出的气息带着咸腥的海水味，却又混杂着实验室特有的消毒水味道。
“那扇门... 父亲的日记里画过。” 莉莉亚的声音颤抖得厉害，指甲深深掐进林小羽的手臂，“他说门后藏着能‘重启时间’的东西，三叶草组织为此杀了所有知情人。” 女孩脖颈处的十字架随着剧烈的心跳轻轻晃动，映在金属墙壁上的影子扭曲成齿轮的形状。
张晨握紧扳手挡在两人身前，烧伤的手臂传来阵阵刺痛。他的拍立得残骸自动启动，拍下门缝里若隐若现的轮廓 —— 那是个巨大的圆柱形舱体，表面缠绕着银色锁链，锁链上密密麻麻刻着三叶草徽标。“小心！” 少年突然拽着林小羽侧身翻滚，一道紫色激光擦着他们头皮掠过，在地面熔出焦黑的坑洞。
船员们的反应各不相同。汤姆瘫坐在墙角，手里还攥着那张泛黄的照片，眼神空洞地望着詹姆斯破碎的机械表残骸。十年前的记忆如潮水般涌来，他想起 “深海号” 出事那天，詹姆斯主动要求进入实验舱调试设备，而自己亲手关闭了舱门。“我以为他死了...” 大副喃喃自语，布满老茧的手指反复摩挲着照片上同伴的脸。
老水手杰克却异常镇定，他将匕首在衣角擦了擦，刀刃上还沾着詹姆斯的 “血液”—— 那其实是泛着蓝光的液态金属。“当年我就该把他彻底解决。” 老人的声音带着悔恨，脖颈处的伤疤随着呼吸起伏，“是我放走了这个怪物，才让更多人受害。” 他的目光扫过培养舱里逐渐消散的克隆体，突然想起某次远航时，在海底看到的那些刻满齿轮图案的古老遗迹。
见习生莉莉亚则处于崩溃边缘，她抱着从克隆体身上扯下的银色碎片，不停念叨着父亲的遗言。当她的目光落在舱体上的锁链时，突然冲向金属门：“那个锁链！父亲说过，只有用三叶草的‘眼泪’才能解开！” 女孩的尖叫被建筑的爆炸声淹没，她手中的银色碎片突然发出强光，与舱体锁链产生共鸣。
林小羽的机械表碎片疯狂震动，陈默的意识带着强烈的不安传来：“别靠近那个舱体！它的能量波动和南极基地的时间熔炉... 一模一样！” 她的钢笔在笔记本上飞速记录，却发现字迹开始扭曲 —— 周围的时间流速正在发生变化。张晨的伤口愈合速度肉眼可见地加快，而莉莉亚的发丝间竟出现了几缕银丝。
“时间悖论场在扩大！” 林小羽大喊，“必须在彻底失控前...” 她的话被舱体传来的轰鸣声打断。圆柱形舱体缓缓升起，露出里面浸泡在绿色液体中的人形轮廓。那人胸口戴着完整的银色项链，面容与陈默、零号有着惊人的相似，却多了几分冷峻。他的双眼紧闭，额头上插着十二根金属导管，导管末端连接着舱体顶部的巨型齿轮装置。
“这是... 三叶草组织的‘最终容器’？” 张晨的声音带着难以置信，拍立得拍下舱体侧面的操作面板 —— 上面的俄文标注着 “project omega”。他想起在伦敦天文台时，兜帽人曾说过 “要让所有错误都被抹去”，此刻终于明白，这个沉睡的克隆体，或许就是他们重启时间的关键。
就在这时，海底建筑的自毁程序启动。红色警报灯闪烁中，詹姆斯的机械表残骸突然悬浮在空中，表盘裂痕中渗出的紫色液体汇聚成一个人脸轮廓。“想阻止时间熔炉？” 那声音混着齿轮转动的嗡鸣，“太晚了... 当‘omega’苏醒，整个世界都将...” 话未说完，零号的数据光点突然出现，将紫色人脸击散。
“哥，小羽，带他们离开！” 零号的声音带着破碎感，“这个舱体连接着地核，一旦启动...” 他的数据光点开始消散，却在最后一刻化作银色锁链，缠住即将暴走的巨型齿轮。林小羽望着零号逐渐透明的身影，想起东京铁塔上那个总是嬉皮笑脸的少年，泪水不受控制地涌出。
“我们不能放弃！” 张晨的扳手砸向舱体的锁扣，金属碰撞声在密闭空间里格外刺耳，“陈玉华一定留了后手！小羽，八音盒！快用它！” 少年的绷带再次渗血，却依然拼尽全力。林小羽颤抖着将八音盒插入舱体的凹槽，齿轮表面的基因纹路与舱体产生共鸣，绿色液体开始沸腾。
在剧烈的震动中，沉睡的克隆体缓缓睁开眼睛。他的瞳孔闪过紫色光芒，抬手的瞬间，所有银色锁链应声断裂。而在建筑外部，海水开始逆向旋转，形成巨大的漩涡。汤姆突然冲过来，将那张泛黄的照片贴在舱体上：“詹姆斯，看清楚！当年我们是为了阻止你！” 照片上年轻的两人笑容灿烂，与眼前的残酷场景形成鲜明对比。
克隆体的目光落在照片上，瞳孔微微收缩。林小羽感觉机械表碎片传来异常波动 —— 某个遥远的地方，十二座城市的地底齿轮同时发出共鸣。而在舱体深处，一个刻着 “chY-2023” 的金属铭牌缓缓升起，上面的齿轮图案与她手中的金色齿轮完美契合。