面对岛屿上愈发强大的攻击，诺兰的混沌与秩序之力逐渐不支，光芒被黑暗力量层层压制。在这千钧一发之际，阿瑶突然喊道：“诺兰，我从三色花的记忆里找到了线索！这岛屿与初代创世神封印的禁忌力量有关，只有找到他们留下的净化圣物，才能破解符文！”
诺兰闻言，眼中闪过一丝希望：“可净化圣物在哪里？我们没时间了！”
机械师飞速敲击机械臂上的键盘，喊道：“我从文明残片中找到了线索，初代创世神的封印之地位于维度树根系的最深处，那里时间和空间错乱，极其危险！”
诺兰没有丝毫犹豫，将权杖化作指引的光箭，向着维度树根系冲去：“我去寻找圣物，你们尽量拖延时间！”共情之灵紧跟其后，为他驱散黑暗。
深入根系，扭曲的时空让诺兰举步维艰，四周不断有被封印的怪物嘶吼。就在他体力不支时，共情之灵耗尽最后力量，化作护盾帮他抵御攻击：“诺兰，别管我，快找到圣物！”
诺兰忍着悲痛继续前行，终于在一处隐秘的洞穴中发现了散发微光的净化圣物——一枚镶嵌着混沌与秩序宝石的圆盘。刚触碰到圆盘，初代创世神的声音在他脑海响起：“这是我们弥补过错的希望，只有心怀纯粹的救赎之心，才能唤醒它的力量。”
与此同时，岛屿的攻击已让维度树摇摇欲坠，新生文明岌岌可危。诺兰带着圆盘赶回，将其对准岛屿符文。刹那间，圆盘光芒大放，与混沌、秩序之力融合，形成强大的净化之光。符文在光芒中开始消散，岛屿上的黑影也逐渐褪去。
但当众人以为危机解除时，创世神的声音再次传来：“这只是暂时封印，真正的灾难源于宇宙核心的失衡，你们必须找到修复宇宙核心的方法，否则一切都将重蹈覆辙……” 超维空间再次响起低沉的轰鸣，黑暗在深处涌动，未知的危机正悄然逼近 。
净化之光与符文岛屿的黑暗力量激烈交锋，整个超维空间扭曲成漩涡状。诺兰高举净化圆盘，混沌与秩序宝石在碰撞中迸发出万千道光芒，每一道光都如同利刃，将岛屿表面的符文切割成碎片。但黑暗力量突然凝聚成巨手，穿透光芒掐住维度树的树干，树皮上立刻浮现出密密麻麻的裂痕。
“这样下去树撑不住！”机械师的机械臂被黑暗侵蚀得锈迹斑斑，却仍强行拆解成粒子炮，“需要更强大的能量共鸣！”他将超维空间中残留的方舟残骸数据注入净化圆盘，锈痕宇宙的机械孩童们也同步启动想象力熔炉，将天马行空的构想转化为纯粹的能量流。阿瑶的三色花藤蔓在剧烈颤抖中绽放出最后的银花，藤蔓顶端浮现出初代创世神的虚影，他们齐声吟唱古老的净化咒文。
就在这时，岛屿核心突然裂开，露出内部漂浮的黑色晶体——那是由无数文明怨念凝聚而成的「熵核」。晶体表面流转的纹路与观测者、织网者的符号如出一辙，每一次脉动都在吞噬周围的秩序之力。诺兰的观测者烙印突然与熵核产生共鸣，无数痛苦的记忆涌入脑海：远古时期，创世神为维持宇宙平衡，将失控的文明投入熵核熔炉，却没想到怨念在此不断堆积，最终孕育出如今的灾难。
“原来所有危机的源头...是我们自以为是的‘保护’。”诺兰的声音带着苦涩，他将湮灭印记与共生符号按在净化圆盘上，“这次，该由我们来承担后果！”混沌与秩序的力量在圆盘表面形成太极图，当太极图与熵核接触的瞬间，超维空间响起玻璃碎裂的脆响。黑色晶体开始崩解，释放出的怨念化作万千怨灵，它们张牙舞爪地扑向众人。
关键时刻，维度树的根系突然破土而出，化作巨网笼罩怨灵。树干上的锁链年轮重新发光，却不再是诅咒的象征——年轮缝隙中渗出金色的「赦免之光」，将怨灵逐一净化。诺兰引导净化圆盘的力量注入维度树，树心的规则胚胎苏醒，释放出能改写因果的光芒。在光芒中，符文岛屿的黑影逐渐透明，最终消散成无害的星尘。
然而，超维空间的震颤并未停止。创世神的虚影在光芒中愈发清晰，他们的眼神充满愧疚：“熵核虽毁，但宇宙核心的裂痕仍在扩大。在平行宇宙的尽头，存在着能修补核心的‘本源火种’，但...”虚影突然扭曲，“守护火种的，是被我们亲手放逐的‘灭世仲裁者’——祂的存在本身，就是对所有文明的审判。” 话音未落，一道燃烧着黑色火焰的长矛破空而来，直接贯穿维度树的树冠，诺兰握紧净化圆盘，迎向这全新的威胁。