天启二十七年（1647年）底，在卢象升未回国就任兵部尚书的前提下，朱由校让范文程暂代兵部尚书一职。
随后，新官上任的范文程一连套组合拳便打了出来。
首先，他在陆军都督府都督张世泽、吴克善的配合下，对全国171万大军进行了整编。
负责京畿防御工作的近卫第1师、第2师，整编为近卫第1军，其余的165个师则整编为了55个军（1军3师制）。
当然，他也没有放过海军。在海军都督府右都督颜思齐的配合下，他同样对海军也进行了大刀阔斧的改革。
他将海军东洋舰队和北洋舰队的建制全部打乱，将两支舰队原有的30艘二级战舰，440艘三级战舰，700艘四级战舰，1000艘五级战舰和1200艘辅助战舰，全部打乱进行了重组。
他先是委任原北洋舰队司令郑芝龙为海军都督府参谋长，太平洋舰队司令，刘宗魁为太平洋舰队副司令兼二分舰队司令。舰队下辖30艘二级战舰，120艘三级战舰，300艘四级战舰，300艘五级战舰，以及480艘辅助舰，并配给了舰队100艘五百吨级的运输补给舰。全舰队合计1230艘战舰，名官兵。
这支舰队将以远洋作战为目的而组建，因此，麾下很多将领都是自南洋舰队调任而来。而原来的舰队大部分海军军官要么退役，要么进入后面成立的近海舰队中。
太平洋舰队麾下将会成立第一分舰队、二分舰队、三分舰队以及补给舰队四支分舰队。分别以郑之虎为第一分舰队司令；刘宗魁兼任第二分舰队司令；林凤仪为第三分舰队司令；郑芝凤为补给舰队司令。
他又以南洋舰队为蓝图，改编其为印度洋舰队，以海军都督府右都督颜思齐为舰队司令兼任第一分舰队司令，谢梦星为舰队副司令兼第二分舰队司令。在进行一系列补充和调整之后，这支舰队下辖六支分舰队，艘军舰。
其中，二级战舰60艘，三级战舰480艘，四级战舰720艘，五级战舰和辅助战舰各900艘，以及新式500吨级运输补给船200艘。区安监队合计3260艘战舰，名官兵。
印度洋舰队的方矩为第三分舰队司令，杨超凤为第四分舰队司令，魏显忠为第五分舰队司令，谢宸崇为第六分舰队司令。
这两支舰队将作为大明帝国唯二的海上主力舰队，他们的敌对目标也略有不同。印度洋舰队未来将以亚非两洲之大洋上任何敌视大明帝国的所有船只，而太平洋舰队则以亚、美两洲海域之敌视大明帝国的所有船只为打击目标。
除了这两支主力舰队之外，范文程还以原东洋舰队为蓝图，将其改编成了近海防御舰队，并以李国助为舰队司令，武国藩、林应龙为副司令。
近海舰队虽然仅有100艘五级战舰，并非是范文程准备放弃这支舰队。恰恰相反，他将近年来海军大学优秀毕业生，以及其他两支舰队比较优秀的年轻将领都集中到了这支舰队里。
比如后世闻名遐迩的施琅，郑芝龙的弟弟郑鸿逵、郑芝豹、郑芝鹏，以及后世并不出名，但都是海军大学优秀毕业生的郭士衡、武张联、武韬、金抱一、王培基等将领。
更为关键的是，大明帝国自天启二十六年（1646年）正式重新启动十年造舰计划，未来十年间将会有60艘一级战舰，120艘二级战舰，240艘四级战舰，480艘五级战舰。
被朱由校称之为大明帝国第二代主力战舰的这900艘战舰可与第一代有着质的不同。
首先，这些战舰将首次采用新型铸铁火炮。其次，整艘战舰的外立面将由一层铜、铁、锡等金属混合物包裹。其防御力已然不必多说。
至于铸铁火炮的性能嘛......
早在万历三十四年（1606年）何汝宾撰写的《兵录》这部军事着作，便详细的介绍了这种大炮的锻造技术。特别是《兵录》中的钻筒图，它展示了如何为铁棒钻孔以制作炮管，这是现代大炮和众多枪械的通用制造工艺。尽管手工制作与机械制造有所差异，但也体现了这种钻孔技术的创新性。
这两年毕懋康和王徵，带着军研院的工匠们突破了一层又一层的管卡，将这铸铁火炮的口径由最初的六磅提升至了十二磅、二十四磅、三十二磅。其有效射程分别达到了1000米、1500米、2000米和2500米。
其中六磅炮，炮管长度1.5米，炮重量0.4吨，最大射程1500米，有效射程1000米，采用：实心弹、散弹、爆破弹和榴散弹等弹种。
十二磅炮，炮身长达1.68米，整体重1吨，该炮以5°的射角将标准的12磅实心炮弹精确投射至1500米外的目标，而在射角为10°时，其射程更是能达到2000米。尽管炮架结构限制了其最大仰角约为12°，但通过垫高炮身等方法，成功使用这款火炮对3000米外的目标进行了炮击，并最终命中目标。
这两款火炮将在天启二十七年（1647年）开始列装陆军，其海军版也将运用到第二代战舰上。
......
皇帝顶着朝野的巨大压力，不但没有拆撤军队，甚至还有准备继续扩军的打算，这下可捅了马蜂窝。
兵部右侍郎侯峒曾给内阁上书指责范文程，说其将一百六十多个师整编为军的目的是，为将来扩军至一百六十多个军做准备。
兵部档案中，军队建制看似少了三分之二，实际上并没有减少一个兵，纯纯的就是拿满朝文官当猴耍。
还有，此人还提到了，日本岛即将解放，岛中那十几个集团军，百余万大军，朝廷该如何处理？
仗打完了还打算养下去，朝廷每年得花费多少粮食？
侯峒曾一针见血的指出了范文程及其背后的皇帝朱由校的小心思。
这就让朱由校尴尬莫名了，果然，古人诚不欺我。
聪明的很呐！