汉武帝征和元年（公元前 92 年）
春天一月，汉武帝回到长安，来到建章宫。
三月，赵敬肃王刘彭祖去世。刘彭祖娶了江都易王曾经宠幸的淖姬，淖姬生了个儿子，叫淖子。当时淖姬的哥哥是汉朝的宦官，汉武帝召见他问：“淖子这人怎么样？” 他回答说：“淖子欲望很多。” 汉武帝说：“欲望多的人不适合当君主统治百姓。” 又问武始侯刘昌，回答是：“这人没啥大毛病，也没啥特别出彩的地方。” 汉武帝说：“这样就行。” 于是派使者去立刘昌为赵王。
夏天，发生大旱。
汉武帝在建章宫，看到一个男子带着剑进入中龙华门，怀疑他不是普通人，就下令抓捕。那男子扔掉剑就跑，追也没追上。汉武帝大怒，把看守宫门的官员给斩了。冬天十一月，征发三辅地区的骑士，在长安上林苑进行大规模搜捕，还关闭长安城门进行排查，十一天后才解除戒严。巫蛊之祸就从这时开始了。丞相公孙贺的夫人君孺，是卫皇后的姐姐，公孙贺因此受到宠信。公孙贺的儿子公孙敬声接替父亲担任太仆，骄横奢侈，不遵守法令，擅自挪用北军的一千九百万钱，事情败露后，被关进监狱。当时朝廷正紧急下诏抓捕阳陵的大侠朱安世，公孙贺就主动请求去追捕朱安世，来赎公孙敬声的罪，汉武帝答应了。后来真的抓到了朱安世。朱安世笑着说：“丞相这下要大祸临头，牵连宗族了！” 于是从狱中上书，告发 “公孙敬声和阳石公主私通；皇上要去甘泉宫的时候，他们让巫师在驰道上埋人偶，诅咒皇上，说了很多恶毒的话”。
汉武帝征和二年（公元前 91 年）
春天一月，公孙贺被关进监狱，经过审讯查验，父子俩都死在狱中，整个家族也被灭族。汉武帝任命涿郡太守刘屈氂为左丞相，封他为澎侯。刘屈氂是中山靖王的儿子。
夏天四月，刮起大风，房子被吹倒，树木被折断。
闰月，诸邑公主、阳石公主以及皇后弟弟的儿子长平侯卫伉，都因为巫蛊的罪名被诛杀。
汉武帝前往甘泉宫。
当初，汉武帝二十九岁才生下戾太子刘据，非常宠爱他。等太子长大后，性格仁慈宽厚、温和谨慎，汉武帝却嫌他才能不足，不像自己。而汉武帝宠爱的王夫人生了儿子刘闳，李姬生了儿子刘旦、刘胥，李夫人生了儿子刘髆，皇后和太子的恩宠逐渐减少，他们心里常常感到不安。汉武帝察觉到了，就对大将军卫青说：“汉朝很多事情都是刚刚开创，再加上周边的少数民族侵犯中原，如果我不改变制度，后世就没有可以遵循的准则；不出兵征伐，天下就不会安宁，为了这些不得不让百姓受苦。要是后世子孙也像我这样做，那就重蹈秦朝灭亡的覆辙了。太子稳重好静，一定能让天下安定，不会让我担忧。想要找一个能守成的君主，还有谁比太子更合适呢！听说皇后和太子有不安的想法，真有这回事吗？你可以把我的意思告诉他们。” 大将军卫青叩头谢恩。皇后听说后，摘下头上的簪子向汉武帝请罪。太子每次劝谏汉武帝不要征伐四方少数民族，汉武帝就笑着说：“我来承担这些辛劳，把安逸留给你，不也挺好吗！”
汉武帝每次外出巡视，经常把后事托付给太子，宫内的事务托付给皇后。太子处理完事情，等汉武帝回来，就把重要的事情汇报给他，汉武帝也没什么异议，有时候甚至都不过问。汉武帝执法严厉，任用了很多严苛的官吏。太子却宽厚待人，经常为被冤枉的人平反，虽然得到了百姓的民心，但那些执法的大臣们都不高兴。皇后担心这样下去时间长了会获罪，常常告诫太子，应该留意汉武帝的意思，不应该擅自有所纵容或赦免。汉武帝听说后，认为太子做得对，皇后的想法不对。群臣中那些宽厚老实的人都归附太子，而那些严苛执法的人都诋毁太子。奸邪的臣子党羽众多，所以太子得到的赞誉少，诋毁却很多。卫青去世后，太子失去了外戚势力的依靠，大臣们竞相想要陷害太子。
汉武帝和儿子们关系疏远，皇后也很少能见到他。太子曾经去拜见皇后，待了很长时间才出来。黄门苏文就向汉武帝报告说：“太子和宫里的人嬉戏玩乐。” 汉武帝就给太子宫增加到二百人。太子后来知道了这事，心里很记恨苏文。苏文和小黄门常融、王弼等人经常偷偷观察太子的过错，然后添油加醋地报告给汉武帝。皇后气得咬牙切齿，让太子向汉武帝奏明诛杀苏文等人。太子说：“只要自己不犯错，何必怕苏文这些人！皇上很聪明，不会相信奸邪小人的话，没什么可担忧的。” 汉武帝曾经身体不舒服，让常融去召太子，常融回来说 “太子脸上有喜色”，汉武帝听了没说话。等太子到了，汉武帝观察他的表情，发现他脸上有哭过的痕迹，却假装谈笑，汉武帝觉得很奇怪，经过仔细询问，了解了真实情况，就把常融杀了。皇后也很注意自我防范，避免嫌疑，虽然很久没有得到宠爱，但还是受到礼遇。
当时，方士和各路神巫大多聚集在京城，他们大多用旁门左道迷惑众人，各种变幻把戏无所不为。女巫们在宫中往来，教宫中的美人躲避灾祸的办法，每间屋子都埋下木人进行祭祀。因为妒忌、怨恨而互相辱骂，又互相告发，说对方诅咒皇上，大逆不道。汉武帝大怒，因此被杀的后宫之人和大臣，有好几百人。汉武帝心里已经开始怀疑，有一次白天睡觉，梦到好几千个木人拿着棍子要打他，汉武帝惊醒后，从此身体不舒服，变得精神恍惚，记忆力减退。江充因为和太子以及卫氏家族有矛盾，看到汉武帝年纪大了，害怕汉武帝去世后被太子诛杀，就趁机干坏事，说汉武帝生病是因为有人用巫蛊之术诅咒。于是汉武帝任命江充为使者，负责处理巫蛊案件。江充带着胡巫到处挖地寻找人偶，抓捕施行巫蛊和夜里祭祀、能看见鬼的人，还故意弄脏一些地方，让人看起来像是施蛊的场所，然后就把人抓起来审讯治罪，用烧红的铁钳夹人、用烙铁烫人，强迫他们认罪。百姓们也互相诬告对方施行巫蛊，官吏们就弹劾他们大逆不道。从京城、三辅地区一直到各郡、国，因为这事儿被处死的前后有好几万人。
当时，汉武帝年纪大了，怀疑身边的人都在用巫蛊诅咒他；不管有没有这回事，都没人敢为那些被冤枉的人申冤。江充知道汉武帝的心思后，让胡巫檀何说：“宫中有蛊气，如果不除掉，皇上的病永远不会好。” 汉武帝就派江充进宫，到皇宫的各个地方，拆掉御座，挖地找蛊；又派按道侯韩说、御史章赣、黄门苏文等人协助江充。江充先从很少被宠幸的后宫夫人查起，依次查到皇后和太子宫，把地挖得乱七八糟，太子和皇后连放床的地方都没有了。江充说：“在太子宫挖到的木人特别多，还有写在帛书上的话，说的都是大逆不道的内容，应当奏明皇上。” 太子害怕了，问少傅石德该怎么办。石德担心自己作为太子的师傅会一起被杀，就对太子说：“之前丞相父子、两位公主以及卫氏家族的人都因为巫蛊之罪被杀，现在巫师和使者在太子宫挖到了证据，也不知道是巫师故意放的，还是真的有，根本没办法证明自己的清白。可以假传圣旨，把江充等人抓起来关进监狱，彻底追查他们的奸诈行为。况且皇上在甘泉宫生病，皇后和家里的官吏去请安都没有回音，皇上是生是死都不知道，而奸臣却如此嚣张，太子难道不考虑秦朝扶苏的事情吗？” 太子说：“我是皇上的儿子，怎么能擅自诛杀大臣呢！不如去皇上那里谢罪，或许能侥幸无罪。” 太子正要前往甘泉宫，可江充逼得太紧；太子实在想不出别的办法，就听从了石德的计策。
秋天七月壬午日，太子派门客假装成使者，抓捕了江充等人。按道侯韩说怀疑使者有诈，不肯接受诏书，太子的门客就把韩说杀了。太子亲自监斩江充，骂道：“你这个赵国来的奴才！之前扰乱你们赵国国王父子还不够吗！现在又来扰乱我们父子！” 还把那个胡巫在皇宫的上林苑里烧死了。
太子派舍人无且拿着符节在夜里进入未央宫殿的长秋门，通过长御倚华向皇后详细说明了情况，然后调发宫中马厩的车子，装载射手，取出武库中的兵器，调发长乐宫的卫队。长安城里一片混乱，都说太子造反了。苏文趁机逃走，跑到甘泉宫，向汉武帝报告太子造反的事。汉武帝说：“太子肯定是害怕了，又怨恨江充等人，所以才发生这样的变故。” 于是派使者去召太子。使者不敢进去，回来报告说：“太子造反已成事实，还想杀我，我逃回来了。” 汉武帝大怒。丞相刘屈氂听说发生变故，起身就逃，连丞相的印绶都丢了，派长史乘坐驿站的快车向汉武帝报告。汉武帝问：“丞相在做什么？” 长史回答说：“丞相封锁消息，不敢发兵。” 汉武帝生气地说：“事情都已经闹得沸沸扬扬了，还封锁什么消息！丞相没有周公的风范，周公当年不就杀了管叔、蔡叔吗！” 于是赐给丞相玺书说：“捕杀造反的人，该赏该罚都有明确规定。用牛车作为屏障，不要和叛军短兵相接，以免过多杀伤士兵！紧闭城门，不要让造反的人出城！” 太子也向百官宣告说：“皇上在甘泉宫生病，情况危急，我怀疑有变故，奸臣想要叛乱。” 汉武帝于是从甘泉宫赶来，来到长安城西的建章宫，下诏征发三辅地区附近各县的军队，让各部中俸禄二千石以下的官员，都归丞相统领。太子也派使者假传圣旨，赦免长安城中各官府的囚徒，命令少傅石德和宾客张光等人分别率领；派长安的囚徒如侯拿着符节征发长水和宣曲的胡人骑兵，让他们都装备好前来会合。侍郎马通出使长安，趁机追捕如侯，并告诉胡人骑兵说：“符节是假的，不要听从！” 于是斩杀如侯，带领骑兵进入长安；又征发水军交给大鸿胪商丘成指挥。当初，汉朝的符节都是纯红色的，因为太子也拿着红色符节，所以把符节改成黄色的，并在上面加上旄饰来区别。
太子站在北军南门外，召见护北军使者任安，把符节交给他，命令他发兵。任安行礼接受符节，进入军营后，却紧闭营门，不再出来。太子只好带兵离开，驱使长安四市的百姓几万人，来到长乐宫的西阙下，与丞相的军队相遇，双方交战了五天，死了好几万人，鲜血流进了水沟里。民间都说太子造反，所以众人都不归附太子，丞相的兵力却越来越多。
庚寅日，太子兵败，向南逃到覆盎城门。司直田仁负责关闭城门，他认为太子和皇上是父子关系，不忍心逼迫太急，太子因此得以出城逃亡。丞相想斩杀田仁，御史大夫暴胜之对丞相说：“司直是俸禄二千石的官员，应该先请示皇上，怎么能擅自斩杀呢！” 丞相就放了田仁。汉武帝听说后大怒，派人责问御史大夫说：“司直放走造反的人，丞相杀他，这是符合法令的；你为什么擅自阻止丞相！” 暴胜之非常惶恐，自杀了。汉武帝下诏派宗正刘长乐、执金吾刘敢拿着策书收回皇后的玺绶，皇后自杀。汉武帝认为任安是个老官吏，看到战事兴起，想坐观成败，谁胜了就归附谁，怀有二心，就把任安和田仁都判处腰斩。汉武帝因为马通抓住了如侯，长安男子景建跟随马通抓住了石德，商丘成奋力作战抓住了张光，就封马通为重合侯，景建为德侯，商丘成为秺侯。那些太子的宾客，只要曾经出入宫门的，都被处死；那些跟随太子发兵的，按照造反的罪名灭族，被太子的军队劫持的官吏和士兵，都被流放到敦煌郡。因为太子在外面逃亡，开始在长安各城门设置屯兵。
汉武帝非常愤怒，群臣都担忧害怕，不知道该怎么办。壶关三老令狐茂上书说：“我听说父亲就像天，母亲就像地，儿子就像万物，所以天平和、地安宁，万物才能茂盛生长；父亲慈爱、母亲疼爱，儿子才能孝顺。如今皇太子是汉朝的正统继承人，肩负着传承万世的大业，承担着祖宗的重任，论亲近他是皇帝的嫡长子。江充不过是个平民百姓，市井中的小臣罢了；陛下却提拔重用他，他却凭借皇上的命令逼迫皇太子，编造奸诈的罪名，一群奸邪小人狼狈为奸，导致皇室亲戚之间的关系隔绝不通。太子想进见皇上却见不到，退后又被乱臣所困，心中独自冤屈却无处诉说，忍不住心中的愤恨，起来杀了江充，又因为恐惧而逃亡，这就像儿子盗用父亲的兵器，是为了自救免遭灾难罢了。我私下认为太子没有谋反的心思。《诗经》说：‘嗡嗡乱飞的苍蝇，停在篱笆上。和乐平易的君子，不要听信谗言。谗言没有止境，会使四方国家陷入混乱。’以前江充进谗言害死了赵太子，天下人没有不知道的。陛下不仔细考察，过分责怪太子，大发雷霆，发动大军去追捕太子，还让三公亲自率军。有智慧的人不敢说话，善辩的人不敢进谏，我私下里为此感到痛心！希望陛下放宽心，不要忧虑，稍微体察一下自己的亲人，不要担心太子会做出错事，赶紧停止军事行动，不要让太子长期逃亡在外！我怀着诚挚的心情，冒死上书，在建章宫下等待皇上治罪！” 奏书呈上后，汉武帝有所感悟，但还没有公开下令赦免太子。
太子逃亡，向东到了湖县，藏在泉鸠里；主人家境贫寒，经常靠卖鞋来供养太子。太子有个老朋友在湖县，听说他很富有，就派人去叫他，结果因此被发现。
八月辛亥日，官吏前来围捕太子。太子自己估计无法逃脱，就进入屋内，紧闭房门，上吊自杀。山阳男子张富昌是个士兵，用脚踢开门，新安令史李寿赶紧上前抱住太子，想解开绳索。主人与前来抓捕的人搏斗而死，太子的两个皇孙也一同遇害。汉武帝得知太子死讯后很伤心，就封李寿为邘侯，张富昌为题侯。
当初，汉武帝为太子修建了博望苑，让他结交宾客，按照自己的喜好行事，所以太子的宾客中很多人用一些奇谈怪论来进言。
司马光评论说：古代圣明的君主教养太子，会为他挑选正直、敦厚、善良的人，作为太子的太保、太傅、老师和朋友，让太子朝夕和他们相处。太子身边前后都是正直的人，出入起居都遵循正道，即便这样，还是有人会因为放纵、邪僻而陷入灾祸、走向败亡。现在却让太子自己结交宾客，随心所欲。正直的人难以亲近，阿谀奉承的人却容易迎合，这本来就是普通人的常情，难怪太子最终没有好的结局啊！
癸亥日，发生地震。
九月，商丘成被任命为御史大夫。
立赵敬肃王的小儿子刘偃为平干王。
匈奴侵入上谷、五原，杀害掳掠当地的官吏和百姓。
评论
这段历史呈现出汉武帝晚期宫廷内外的风云变幻与巨大悲剧。巫蛊之祸成为这场悲剧的导火索，它像一场疯狂的风暴，席卷了整个西汉宫廷与朝堂，众多皇室成员、大臣因此丧命，无数家庭支离破碎。
从汉武帝角度看，他晚年的多疑与迷信，给了江充等奸佞小人可乘之机，让巫蛊之风盛行，成为帝国政治生态恶化的开端。他与太子之间因性格、治国理念的差异，加上奸臣从中挑拨，使得父子关系逐渐疏远，最终酿成大祸，反映出封建帝王在权力与亲情之间的失衡，以及对宫廷局势把控的失控。
太子刘据，原本仁恕温谨，深得民心，却因奸臣陷害，走投无路起兵反抗，最终兵败自杀。他的遭遇令人惋惜，凸显出在封建宫廷斗争中，即便身为太子，面对奸佞与帝王猜忌时的无奈与无力。
这场祸事也暴露出当时政治体系的脆弱与腐败。官员们为求自保或争权夺利，相互倾轧，利用巫蛊事件构陷他人，使得朝廷上下人心惶惶。而百姓也深受其害，因巫蛊诬告之风，众多无辜之人丧命，社会秩序遭受严重破坏。
此外，壶关三老令狐茂的上书，虽让汉武帝有所感悟，但未能及时挽回局面，也反映出封建专制体制下，正确意见传达与纠错机制的滞后与艰难。总之，巫蛊之祸是西汉由盛转衰的重要转折点，它警示着统治者在维护统治过程中，应保持清醒，远离奸佞，平衡权力与亲情，确保政治清明与社会稳定。