康熙的朱批一下，韦小葆立刻行动起来。他深知，一个组织的效能，很大程度上取决于其初始的架构设计。他不能将技术总局办成另一个臃肿、低效、充斥着人浮于事的传统衙门。他要打造的，是一个高效、专注、能够激发创造力、并能将成果快速转化的新型机构。这需要超越这个时代的管理智慧。
他没有急于招募大量人手，而是先将自己关在书房三天。书桌上铺满了大幅宣纸，上面用炭笔画满了各种方框、线条和箭头，旁边标注着只有他自己能完全看懂的符号和缩写——那是他基于现代组织管理学、项目管理以及矩阵式结构等理念，为技术总局量身定制的架构蓝图。
首先，他明确了技术总局的核心定位与目标：
核心定位：皇帝直辖的、非营利性的国家级应用技术研发与推广中心。
核心目标：系统性解决农业、水利、工矿、医药等领域的实际问题，提升国力与民生，并逐步建立一套独立于传统儒学科举的“技术官僚”培养与晋升体系。
基于此，他设计了扁平化、项目导向的组织结构：
顶层：总局管理委员会
由他本人（总管大臣）担任主席，下设两名协理大臣（计划从工部、户部调任或由他举荐，以协调资源），一名总簿记（负责财务、物资），一名总文书（负责档案、公文、情报收集）。委员会负责制定总体规划、审批重大项目、分配资源、协调内外关系。
中层：五大专业技术分署
这是技术总局的核心执行部门，并非按传统衙门品级划分，而是按专业领域垂直管理：
1. 农学署：专注于作物育种、土壤改良、肥料研制、病虫害防治、新式农具研发。下设试验田管理、种子库、农技推广等分支。
2. 水利署：研究江河治理、灌溉工程、水文测量、水患预防。核心任务是建立黄河、淮河等主要水系的动态模型，进行模拟实验，提出综合治理方案。
3. 工学署：范围最广，涵盖军械改良（在严格控制下）、纺织机械、采矿冶金、土木建筑、交通运输工具改进等。强调标准化、可量产化。
4. 医药署：并非传统中医堂，而是侧重于公共卫生（如饮水消毒、垃圾处理）、流行病防治、伤科急救、药材规范化种植与炮制，并开始有意识地搜集、验证民间及域外的医药知识。
5. 格致基础署：这是韦小葆埋下的伏笔。名义上研究“格物致知之理”，实际负责数学、物理、化学等基础学科的研究、知识整理与传授，为其他各署提供理论支持，也是未来培养高级技术人才的摇篮。暂时规模最小，但权限独立。
特色设置：
项目管理制：每个分署内的具体任务，均以“项目”形式运作。设立项目负责人，明确目标、预算、时间表和所需资源。项目成员可能来自不同分署，形成矩阵结构。项目完成后进行评估，成果显着者重奖。
技术标准委员会：由各领域资深工匠和学者组成，负责制定和审核技术成果的标准、规范，确保推广质量。
成果转化与推广处：专门负责将成熟的技术成果，通过出版通俗手册、派遣技术人员指导、与地方官府合作示范等方式，推向民间。这是实现“利国利民”的关键一环。
档案情报中心：系统收集、整理、归档国内外一切有用的技术资料、文献、实物样本，建立检索系统，实现知识共享。
独立核算与激励体系：韦小葆利用自己捐赠的启动资金和后续可能争取到的拨款，设立了独立的账户。推行“基本俸禄+项目绩效+成果奖励”的薪酬制度，打破大锅饭，激励创新。对于有重大贡献的工匠或学者，甚至可以破格授予荣誉官职或巨额奖金。
人事与招募原则：
唯才是举：公开张榜，不同出身，无论士农工商，只要在算学、工巧、农事、医药等某一方面有真才实学，均可经考核后录用。甚至允许有特殊技能的西洋传教士担任顾问（需严格审查）。
职责明确：每个岗位都有清晰的职位说明书，明确责任、权力和考核标准。
持续学习：定期组织内部技术交流会，鼓励跨领域合作。计划未来在格致基础署下开设培训班，系统传授数学、几何、基础物理化学知识。
设计完成后，韦小葆将其整理成一份详细的《大清技术总局组织章程与办事细则》，再次呈报康熙御览。这份章程条理之清晰、考虑之周全、理念之新颖，让康熙也大为惊叹。他虽对其中一些过于“离经叛道”的设置（如独立的薪酬体系、工匠可受重奖）略有疑虑，但整体上认可了其高效和务实的方向，最终朱批：“依议。试行之。”
拿着这份经过皇帝认可的章程，韦小葆开始了实质性的组建工作。他亲自选定了一处位于京郊、原属于内务府的废弃琉璃厂作为总局衙署，这里场地宽阔，且有现成的工作坊基础。他协调内务府和工部进行修缮改造，按照功能分区重新规划。
同时，招募榜文也以皇帝的名义下发各州县。榜文内容极具诱惑力，不仅列出了优厚的待遇，更承诺“但有一技之长，能利国利民者，不问出身，量才录用，卓有成效者，不吝爵赏之赐！”
消息传出，顿时在士林和民间引起了不小的震动。传统的读书人对此多嗤之以鼻，认为这是“奇技淫巧，蛊惑圣心”，是韦小葆这个幸进之臣的又一场闹剧。然而，那些沉沦下僚、精通算学却无科举门路的底层官吏，那些身怀绝技却地位低下的工匠，那些对农业水利有独到见解的老农和河工，却从中看到了一丝前所未有的希望。
一股暗流，开始向着京郊那座正在修缮中的旧琉璃厂汇聚。韦小葆用他超越时代的架构设计，为技术总局搭建起了坚实的骨架，接下来，便是为其注入血肉与灵魂的时刻。他的“帝国”雏形，第一次有了清晰可见的组织形态。