确定灵脉极端者的秘密基地位于远古灵脉废墟后，林共生立刻对岩晶主星的防御进行最终部署 —— 由土芽带领半数土脉守护队与岩晶平衡师留守封印塔，24 小时监测封印状态；水溪带领治愈队在岩晶主星建立临时医疗站，随时准备支援；星落的星辰队则扩大监测范围，覆盖远古灵脉废墟与岩晶主星之间的星空，一旦发现灵脉极端者的动向，立刻通报。
做好防御安排后，林共生带领年轻灵能师团队、混沌芽、火烈及剩余跨文明防御队，乘坐升级后的 “共生号”，朝着远古灵脉废墟出发。此次航行需穿越灵脉共生带外侧的 “混沌乱流区”，那里空间结构极不稳定，混沌能量与灵脉能量交织成漩涡，普通飞船根本无法通行。为此，混沌芽特意为 “共生号” 加装了 “混沌能量稳定器”，能中和乱流中的混沌能量，确保飞船安全航行。
经过五天的艰难航行，“共生号” 终于抵达远古灵脉废墟。当飞船穿过最后一层混沌乱流时，所有人都被眼前的景象震撼 —— 这片废墟曾是一颗直径超十万公里的巨型星球，如今却因远古内战分裂成无数破碎的星块，星块表面覆盖着暗红色的 “灵脉焦土”，焦土中残留着强烈的灵脉能量波动，偶尔闪过的淡红色光纹，如同星球未熄灭的 “伤口”；废墟的中心，悬浮着一座完整的 “远古灵脉神殿”，神殿表面刻满了灵脉至上符文，顶端闪烁着暗红色的光芒，正是灵脉极端者秘密基地的能量来源。
“灵脉极端者的基地就在神殿里！” 晶闪用水晶仪器扫描神殿，语气凝重，“神殿周围布置了‘灵脉隔离屏障’，能阻挡外部灵能探测，而且屏障中蕴含着大量异常灵脉能量，一旦触碰，就会触发攻击陷阱！”
为了突破灵脉隔离屏障，林共生带领团队在废墟边缘的一块星块上建立临时营地，研究屏障的破解方法。混沌芽尝试用混沌能量中和屏障能量，却发现屏障会吸收混沌能量，转化为攻击陷阱的动力；火烈用本源灵能炮轰击屏障，炮弹接触屏障的瞬间就被反弹，反而引发了屏障周围的灵脉爆炸，差点波及营地。
“屏障的能量与灵脉至上之核同源，都是纯粹的远古灵脉能量，” 林共生看着屏障表面流动的红色光纹，突然想起岩晶文明的岩晶能量，“岩晶能量能与灵脉、混沌能量同时产生共鸣，或许能穿透屏障，不触发攻击陷阱！”
岩晶亮（此次随队前往，负责岩晶能量的操控）立刻取出一块岩晶晶体，将岩晶能量注入其中，晶体释放出淡透明的光纹，朝着屏障飞去。奇妙的是，当岩晶能量接触屏障时，屏障表面的红色光纹竟自动分开，形成一道仅容一人通过的通道，通道周围没有任何攻击陷阱触发。
“成功了！” 岩晶亮兴奋地说，“岩晶能量与远古灵脉能量的频率存在‘天然契合度’，屏障会将岩晶能量视为‘同类能量’，不会触发防御机制！”
林共生立刻制定突破计划：由岩晶亮持续释放岩晶能量，维持屏障通道；林共生、混沌芽、火烈带领十名精锐防御队员，组成 “突击小队”，通过通道潜入神殿，探查灵脉极端者的动向；光粒、影芽、声芽带领其余队员，在营地外围构建防御阵，防止灵脉极端者从外部偷袭；晶闪则留在 “共生号” 上，通过水晶技术，实时监测神殿内部的能量波动，为突击小队提供支援。
突击小队通过岩晶能量通道，顺利进入远古灵脉神殿。神殿内部比想象中更加庞大，主殿的地面由暗红色的 “灵脉石” 铺成，石面上刻满了远古灵脉文明的战斗壁画 —— 画面中，灵脉至上派与平衡派（混沌重构者的祖先）展开激烈厮杀，平衡派的灵能师们释放出淡黑色的混沌能量，灵脉至上派则用红色灵脉能量反击，最终，平衡派因寡不敌众，被迫逃离星球。
“原来远古内战的真相是这样……” 混沌芽看着壁画，眼中闪过复杂的情绪，“祖先们为了守护灵脉与混沌的平衡，付出了这么大的代价。”
沿着主殿向前走，突击小队来到神殿的 “核心控制室”。控制室的中央，矗立着一座巨大的 “灵脉能量控制台”，台上摆放着数十个透明的 “能量容器”，每个容器中都装着淡红色的灵脉能量 —— 这些能量正是灵脉极端者从各文明掠夺的灵脉能量；控制台的屏幕上，显示着 “灵脉净化计划” 的详细内容：用灵脉至上之核的能量，激活 “远古灵脉净化阵”，释放出覆盖整个共生宇宙的 “灵脉净化波”，彻底清除宇宙中的混沌能量，将所有文明转化为 “纯灵脉文明”。
“他们疯了！” 火烈愤怒地握紧拳头，“灵脉净化波不仅会清除混沌能量，还会摧毁所有依赖混沌能量生存的生物！这不是净化，是屠杀！”
就在这时，控制室的大门突然关闭，周围的墙壁上弹出数十个 “灵脉能量炮”，炮口对准突击小队；灵脉红带着五十名灵脉极端者，从控制室的侧门走出，每个人的额头都镶嵌着红色灵脉晶体，手中握着灵脉至上剑，散发着狂热的气息。
“林共生，我们早就知道你们会来！” 灵脉红的脸上带着得意的笑容，“这座神殿的每一处都布满了陷阱，你们今天，就是我们灵脉净化计划的‘第一份祭品’！”
灵脉红一声令下，灵脉能量炮同时发射，红色的灵脉炮弹朝着突击小队袭来。林共生立刻下令：“混沌芽，用混沌能量构建防御墙；火烈，带领队员反击灵脉极端者；我来破坏能量炮！”
混沌芽释放淡黑色的混沌能量，在小队前方形成一道坚固的防御墙，挡住灵脉炮弹的攻击；火烈带领队员，手持本源灵能剑，冲向灵脉极端者，一剑就击倒两名极端者；林共生则释放多文明灵能，形成七彩的灵能利刃，精准击中灵脉能量炮的核心，炮体瞬间爆炸，失去攻击能力。
灵脉红见状，亲自上阵，举起灵脉至上剑，释放出 “灵脉净化剑气”—— 这道剑气比之前更强，表面闪烁着淡红色的净化光纹，能瞬间吞噬混沌能量。混沌芽的防御墙接触到剑气时，瞬间被净化成虚无，剑气朝着林共生袭来。
“小心！” 混沌芽大喊，立刻将混沌能量注入林共生的共生核心水晶。水晶释放出淡黑色的混沌能量，与林共生的多文明灵能交织，形成一道 “灵脉 - 混沌协同护盾”。当剑气击中护盾时，护盾表面的光纹剧烈波动，红色的净化光纹与淡黑的混沌光纹相互吞噬，最终，剑气被护盾彻底中和。
“灵脉与混沌的协同能量…… 竟然能抵御净化剑气！” 灵脉红的眼中闪过难以置信，“不可能！混沌能量是邪恶的，怎么能与纯净的灵脉能量共存！”
“你错了！” 林共生坚定地说，“灵脉与混沌不是对立的，而是互补的！远古平衡派早就明白这个道理，他们用混沌能量平衡灵脉能量，才让远古灵脉文明延续了数万年！是灵脉至上派的极端理念，才导致了文明的毁灭！”
灵脉红被林共生的话激怒，他突然按下控制台上的红色按钮，神殿的地面开始剧烈震动，主殿的顶部缓缓打开，露出一颗直径约一公里的 “远古灵脉核心”—— 核心表面刻满了灵脉至上符文，释放出比灵脉至上之核更强的灵脉能量，正是灵脉极端者的 “能量源”。
“既然你们执迷不悟，那就一起被净化吧！” 灵脉红疯狂地大喊，“我要启动远古灵脉净化阵，让整个宇宙都回归灵脉的纯净！”
随着灵脉红的指令，远古灵脉核心释放出强烈的红色光纹，光纹顺着神殿的地面，流入主殿四周的 “阵眼”，灵脉净化阵开始启动。阵眼周围的地面出现红色的符文，符文连接成一张巨大的 “净化网”，网中释放出淡红色的净化能量，朝着突击小队袭来。
“净化能量会吞噬我们的灵能！快撤离！” 火烈大喊，带领队员朝着控制室的大门退去。但大门已被净化能量封锁，队员们的灵能开始被净化能量吸收，脸色逐渐变得苍白。
就在这危急时刻，晶闪通过通讯器传来紧急消息：“林共生队长！我在神殿的数据库中发现了远古平衡派留下的‘真相记录’！灵脉至上之核不是灵脉至上派的能量源，而是平衡派为了封印灵脉净化阵制造的‘平衡核心’！远古内战的最后，平衡派为了阻止灵脉至上派启动净化阵，将平衡核心封印在岩晶星球，没想到反而被灵脉极端者当成了启动净化阵的钥匙！”
“平衡核心！” 林共生恍然大悟，“灵脉极端者想要用平衡核心启动净化阵，简直是本末倒置！只要我们能将平衡核心的能量注入净化阵的阵眼，就能逆转净化能量，关闭净化阵！”
但平衡核心还在岩晶星球的封印塔中，远水解不了近渴。混沌芽突然想到了办法：“我能感应到远古灵脉核心中残留的平衡派灵能！只要我们能唤醒这些灵能，就能暂时替代平衡核心，逆转净化阵！”
混沌芽走到远古灵脉核心前，释放出混沌能量，将手贴在核心表面。她闭上眼睛，用灵能与核心中的平衡派灵能建立连接：“平衡派的祖先们，现在是时候醒来了！你们当年守护的平衡，正在被极端者破坏，只有你们的灵能，才能阻止这场灾难！”
随着混沌芽的呼唤，远古灵脉核心中突然释放出淡黑色的混沌灵能，这些灵能正是平衡派当年注入的 “平衡灵能”。平衡灵能顺着混沌芽的手，流入净化阵的阵眼，与净化能量相互交织。
“就是现在！” 林共生大喊，带领团队释放多文明灵能，注入阵眼。灵脉、混沌、岩晶能量交织在一起，形成一道 “共生平衡能量”，顺着阵眼流入净化阵的核心。瞬间，净化阵的红色光纹开始褪色，淡红色的净化能量逐渐转化为淡白色的平衡能量，灵脉净化阵被成功逆转，变成了 “灵脉 - 混沌平衡阵”。
灵脉红看着眼前的景象，彻底崩溃：“不可能…… 这不是真的…… 灵脉怎么能与混沌平衡……”
净化阵的逆转让灵脉极端者的灵能失去了支撑，他们的红色灵脉晶体开始破碎，灵能快速流失。灵脉红试图再次启动净化阵，却被混沌芽释放的混沌能量击中，红色灵脉晶体彻底破碎，失去了战斗力。
“灵脉红，你现在明白了吗？” 林共生走到灵脉红面前，语气平静，“远古文明的毁灭，不是因为混沌能量，而是因为极端理念。只有灵脉与混沌的平衡，才能让文明持续发展，这才是共生宇宙的真谛。”
灵脉红看着自己破碎的灵脉晶体，眼中闪过悔恨：“我…… 错了…… 我一直以为自己在守护灵脉的纯净，没想到反而走上了与远古灵脉至上派相同的道路……”
灵脉净化阵被关闭后，远古灵脉神殿的能量逐渐稳定。林共生带领团队，将灵脉极端者的残余成员制服，没收了他们的灵脉至上武器。对于愿意放弃极端理念的极端者，林共生决定将他们带回星蓝星，由平衡派的后代（混沌重构者）教导灵脉 - 混沌平衡知识，帮助他们重新认识共生的意义；而执迷不悟的极端者，则被关押在岩晶星球的临时监狱，接受进一步的教育。
处理完灵脉极端者后，林共生带领团队，对远古灵脉废墟进行了全面探查。在神殿的数据库中，他们发现了大量平衡派留下的 “灵脉 - 混沌平衡技术”，包括能稳定宇宙能量的 “平衡核心制造方法”、能修复灵脉焦土的 “共生灵植培育技术” 等。这些技术对共生宇宙的发展，有着极其重要的意义。
一个月后，林共生团队返回岩晶星球。他们将远古灵脉核心中的平衡灵能，注入岩晶星球的封印塔，与平衡核心（灵脉至上之核）融合，形成了 “终极平衡核心”。终极平衡核心释放出的平衡能量，不仅加固了封印塔的封印，还通过跨宇宙灵脉网络，输送到共生宇宙的各个星球，进一步稳定了灵脉 - 混沌的平衡比例。
同时，联盟启动了 “远古废墟修复计划”—— 组织各文明的灵能师与科学家，前往远古灵脉废墟，利用平衡派留下的技术，修复破碎的星块，培育共生灵植。经过半年的努力，废墟的部分星块重新长出了绿色的植被，灵脉焦土逐渐恢复成肥沃的土地，甚至有部分星球开始出现新的生命迹象。
这天，林共生带领年轻灵能师团队，再次来到远古灵脉废墟。他们站在重新焕发生机的星块上，看着远处正在培育共生灵植的各文明成员，心中满是感慨。
“没想到，这里竟然能从废墟变成生机盎然的星球，” 光粒笑着说，“或许用不了多久，这里就能成为新的文明家园。”
林共生点点头：“这就是共生的力量 —— 它能让废墟重生，能让极端者醒悟，能让不同的文明，为了同一个目标共同努力。未来，还会有新的挑战出现，但只要我们坚守平衡的信念，就没有什么能阻挡共生宇宙的发展。”
夕阳西下，远古灵脉废墟的星块上，共生灵植的枝叶闪烁着淡绿色的光纹，与远处的远古灵脉神殿相互呼应，形成一道美丽的景象。年轻守护者团队的成员们站在光纹中，眼神坚定。