跨模式共生学院建立后，中立共生区迅速繁荣起来。越来越多的联盟和域外文明生物涌入这里，开设商店、建立科研机构、组建家庭，形成了一个多元共存的小社会。这里既有联盟的共生能量设施，也有域外的非共生基因稳定装置；既有联盟的跨文明艺术展览，也有域外的岩石雕塑展；既有跨文明家庭的温馨居所，也有域外文明的独立聚居点。
中立共生区的核心区域，是 “多元市场”—— 这里汇集了双方的特色商品：联盟的本源基因能量晶体、虚空能量采集器、跨文明手工艺品；域外的黑色岩石工具、非共生基因稳定器、基因纯净度检测仪。市场里，两种模式的生物用基因共生芯片或语言交流，讨价还价，氛围热闹而和谐。
“这个能量晶体能提升共生能量的稳定性，对你们的非共生基因也有轻微的保护作用，很实用。” 联盟的商人向域外生物介绍道。域外生物接过晶体，通过适配装置测试后，满意地说：“确实不错，我用我们的岩石工具和你交换。”
除了商品交易，中立共生区的科研合作也日益深入。除了联合建立的基因适配实验室，双方还成立了 “跨模式能源研究所”“基因安全中心” 等机构，共同研发解决宇宙能源短缺、基因危机的技术。在跨模式能源研究所，联盟的虚空能量技术与域外的基因稳定技术结合，研发出了 “双模式能量发生器”—— 既能为共生型生物提供本源能量，也能为非共生型生物提供稳定的非共生能量，解决了中立共生区的能源供应问题。
但繁荣的背后，也出现了一些摩擦。最主要的矛盾，是 “生活方式的差异”：联盟生物习惯了开放、共享的生活，喜欢聚集在一起交流；域外生物则习惯了独立、封闭的生活，注重个人空间，不喜欢被打扰。
在中立共生区的居民区，曾发生过这样的冲突：几名联盟生物在公共区域举办跨文明音乐会，声音较大，影响了附近域外生物的休息。域外生物上门抗议，认为联盟生物侵犯了他们的个人空间；联盟生物则认为公共区域可以自由活动，双方发生了争执。
“我们的生活习惯是独立安静，你们的噪音影响了我们的基因稳定。” 域外生物的代表说道。联盟生物则反驳：“公共区域是大家的，我们有权利举办文化活动。”
冲突很快上报到中立共生区的管理委员会。管理委员会由联盟和域外文明的代表共同组成，王启任命李晶担任委员会的年轻代表，负责调解年轻一代的矛盾。李晶了解双方的文化和生活习惯，提出了一个解决方案：将公共区域划分为 “共享区” 和 “安静区”，共享区可以举办文化活动、集体交流；安静区则禁止大声喧哗，保障喜欢独立生活的生物的需求。
这个方案得到了双方的认可。共享区成为了联盟生物举办活动、交流互动的场所；安静区则成为了域外生物休息、独立研究的空间。矛盾化解后，双方生物都更加注重尊重彼此的生活习惯，中立共生区的氛围变得更加和谐。
另一个摩擦是 “基因技术的使用边界”。联盟生物习惯了使用基因共生芯片、基因缓冲器等技术，认为技术能提升生活质量；域外生物则对基因技术的使用非常谨慎，认为过度使用技术会破坏基因的纯净度。
在跨模式共生学院，曾有联盟学生使用基因优化技术，提升了自己的学习效率，引起了域外学生的不满：“你使用技术改变基因，违背了基因纯净的原则，对我们不公平。”
联盟学生反驳：“基因优化技术没有改变我的原生基因，只是提升了基因的活性，这和你们使用基因稳定技术是一样的，都是为了让自己变得更好。”
为了解决这个问题，管理委员会制定了《中立共生区基因技术使用公约》，明确规定：基因技术的使用，不得改变原生基因的核心特性，不得侵犯他人的基因安全，不得在公共场合强制他人使用基因技术。公约既尊重了联盟生物使用技术的习惯，也照顾了域外生物对基因纯净的重视，得到了双方的遵守。
这些摩擦的化解，让中立共生区的管理体系更加完善，也让双方生物的相互理解更加深入。联盟生物学会了尊重他人的独立空间，域外生物也逐渐接受了适度的基因技术。中立共生区的繁荣，不再是表面的热闹，而是深层次的和谐共存。
王启在视察中立共生区时，看着共享区里一起举办活动的联盟和域外生物，看着安静区里各自专注做事的生物，心里充满了成就感。他知道，中立共生区的成功，证明了多元共存的可行性 —— 不同模式、不同习惯的文明，只要相互尊重、相互包容，就能找到共存的平衡点。
而中立共生区的繁荣，也吸引了更多宇宙边界的未知文明前来考察。有一天，中立共生区迎来了一群 “能量型文明” 的生物 —— 他们没有实体，由纯粹的能量构成，基因模式既不是共生型，也不是非共生型，而是 “流动型”。
“我们听说这里有不同模式的文明共存，特意前来学习。” 能量型文明的代表说道，“我们的基因能自由流动，却无法在一个地方长期停留，希望能通过合作，找到稳定生存的方法。”
王启立刻表示欢迎：“中立共生区的大门，向所有文明敞开。我们愿意与你们合作，一起探索多元共存的新可能。”
能量型文明的到来，让中立共生区的多元性更加丰富，也让联盟的多元共生体系，迎来了新的挑战和机遇。王启知道，宇宙的文明形态无穷无尽，多元共存的道路没有终点，但只要坚守尊重、包容、合作的初心，就一定能让中立共生区成为宇宙和平的灯塔，照亮更多文明的共存之路。