然而好景不长，其他妃嫔们看到皇后与苏瑶往来密切，心生嫉妒。其中一位贵妃暗中调查苏瑶的医馆，发现了一种珍稀药材，若加以歪曲利用，可以诬陷苏瑶诅咒皇室。于是贵妃买通了医馆内的一个小厮，偷出药材，并在皇上面前哭诉苏瑶居心叵测。皇上大怒，下令查封医馆并将苏瑶打入大牢候审。皇后得知此事后，虽相信苏瑶无辜，但证据确凿难以辩驳。就在苏瑶绝望之时，那位小厮突然良心发现，深知自己诬陷好人罪孽深重，主动向皇后坦白一切。皇后带着小厮面见皇上，真相大白。皇上严惩了贵妃及其党羽，恢复了苏瑶的名誉和医馆。经此一事，后宫众人更加明白争斗只会害人害己，后宫愈发和睦，而苏瑶的医馆也名声大噪，前来求医之人络绎不绝。
随着医馆名声远扬，苏瑶也越发忙碌起来。一日，宫中的贤妃派人来请苏瑶入宫诊治。原来贤妃一直体弱，听闻苏瑶医术高明便想一试。苏瑶精心诊断开方，几剂药下去贤妃病情大有好转。这使得苏瑶在宫中更受敬重。
不久之后，边疆传来捷报，皇帝龙颜大悦。皇后提议举办一场宫宴庆祝。宫宴之上，苏瑶也被邀请参加。众妃嫔难得放下芥蒂，与苏瑶相谈甚欢。期间有人提及希望苏瑶可以在宫中设立一个小医馆，方便宫中众人随时就医。苏瑶欣然答应。
在苏瑶的悉心照料下，后宫之中生病之人逐渐减少。而且因为之前的教训，再也没有人敢轻易生事挑起争斗。苏瑶不仅成了后宫中的福星，还时常给宫女太监们讲授一些简单的医药知识。整个后宫一片祥和之气，皇上见此情形也是满心欢喜，时不时赏赐苏瑶一些珍稀药材，以表嘉奖。苏瑶则用这些药材研制出更多良方，造福众人。日子就这样平静地过着，直到邻国送来一位和亲公主。这位公主年轻貌美，琴棋书画样样精通，很快就得到了皇帝的宠爱。但她自小生活环境优渥，身体却很娇弱，常常生病。她听闻苏瑶医术高超，便召苏瑶前来。
苏瑶仔细诊断后，开出方子。可公主服下几剂药后不见好转，心中不悦，认为苏瑶故意为之。于是在皇帝面前撒娇抱怨，皇帝虽信任苏瑶，但架不住公主的哭闹。
苏瑶再次进宫查看，发现公主是因为水土不服且心中忧思过重才导致病情反复。她耐心解释，并调整药方。同时，苏瑶告知公主家乡的一些趣事，排解她的思乡之情。公主渐渐开朗起来，按新的方子服药后病也好了起来。
皇帝对苏瑶更加赞赏，赏赐不断。苏瑶利用这些赏赐进一步发展医馆，培养更多懂得医术的人，无论是后宫还是宫外百姓都受益良多。而后宫众人看到苏瑶如此尽心尽力，对她更是尊重有加，从此后宫再无波澜，一片安宁繁荣。