当众人以为事情平息时,邻国宫廷却借此发难,欲要关闭医馆。秦墨据理力争,提出当着众人面重新医治患者以证清白。在她妙手回春之下,患者康复如初。民众看到此景,纷纷指责宫廷故意刁难。宫廷无奈,只得放弃打压医馆。经此一难,秦墨医馆名声更盛,各国前来求学之人络绎不绝,秦墨也得以更好地传承医道。随着各国求学者的到来,医馆变得热闹非凡。然而,平静之下暗涌流动。秦墨发现,新来的学徒中有几个举止怪异。经过多日观察,她发觉这几人竟试图窃取医馆的秘方。原来,是之前被打脸的邻国宫廷不甘心失败,派来奸细妄图搞垮医馆。
秦墨心生一计,故意放出假的秘方让奸细得到。奸细不知是计,欣喜若狂地带回去复命。邻国按照假秘方制药,结果病人服用后状况百出。这时,秦墨带着真秘方和证据来到邻国宫廷。
她当众揭露邻国的阴谋,还表明医馆一直秉持悬壶济世之心,希望两国不要再互相算计。邻国君主自知理亏,向秦墨道歉,并承诺严惩涉事者。秦墨大度原谅,回国之后,她加强了医馆的管理,对学徒们更加用心教导,而医馆在经历重重磨难后,终于成为闻名诸国且备受尊敬的医学圣地。几年后,医馆愈发兴盛。一日,一位神秘贵人前来求医。此人遮遮掩掩,秦墨心中起疑但仍尽心诊治。在治疗过程中,秦墨发现他所患病症甚是奇特,并非寻常疾病。
秦墨四处探寻药方,偶然间在古籍中发现线索,竟是一种失传已久的蛊毒所致。她怀疑背后有人蓄意为之,于是暗中调查。最终发现是国内另一股势力嫉妒医馆威望,勾结他国巫医下蛊。
秦墨不动声色,先解了贵人之毒。随后将证据呈给皇上,皇上大怒,惩治了那股势力。医馆再次度过危机,秦墨深知树大招风,此后她不仅钻研医术,还广交善缘。她培养出众多优秀医者,将医馆分号开遍各国。从此,无论贫富贵贱,只要患病之人找到秦氏医馆,皆能得到救治,秦墨的名字也永远载入各国史册,被尊称为神医,受万人敬仰。
多年过去,秦墨已至暮年。她决定挑选一位合适的接班人来掌管医馆。众多弟子中,有一位名叫苏瑶的女子脱颖而出。她聪慧善良且极具医德。秦墨将毕生所学毫无保留传授于她。
就在秦墨准备彻底归隐之时,一场罕见的疫病席卷而来。各国陷入恐慌,许多医者对此病束手无策。苏瑶虽尽力救治,但效果不佳。秦墨听闻后,不顾年迈体弱出山相助。
秦墨凭借丰富的经验,从古籍中找出应对之法。她带领众弟子上山采药,研制新药方。经过日夜奋战,终于成功制出解药。这场疫病过后,医馆的声望达到顶峰。
秦墨欣慰地看着医馆的发展,她知道自己可以安心离去了。在一个宁静的夜晚,秦墨与世长辞。苏瑶继承她的遗志,继续经营医馆,让秦氏医馆的名号永远闪耀,延续着悬壶济世的传奇。