就在军事内阁全力推动军改，各项计划刚刚铺开之际，一份来自四川的加急密报，如同一声惊雷，打破了京师初定的局面。
密报被火速送入宫中，朱常洛阅后，脸色凝重，立刻召见了全体军事内阁成员。
乾清宫西暖阁内，气氛紧张。朱常洛将那份染着川中尘土的密报递给孙承宗，沉声道：“诸位爱卿，看看吧。树欲静而风不止啊！”
孙承宗迅速浏览，脸色骤变，随即传递给袁可立、秦良玉等人。当看到“奢崇明叛乱”、“重庆陷落”、“巡抚徐可求等二十余官员殉国”、“成都被围”等字眼时，所有人的心都沉了下去。他们刚刚经历了一场关乎国运的大战，正待休养生息、推行改革，没想到西南腹地竟又燃起如此凶猛的烽火！
真是屋漏偏逢连阴雨，一浪更比一浪急啊！
“奢崇明，安敢如此！”兵部尚书 黄嘉善气得胡须直抖。
四川乃天府之国，财税重地，一旦有失，后果不堪设想。
秦良玉更是双拳紧握，指甲几乎掐进肉里。石柱宣慰司与永宁宣慰司（奢崇明部）同处川东，她对奢崇明的野心早有耳闻，却未料其竟敢在朝廷刚获大捷、权威正隆之时悍然造反！
“陛下，情况危急！” 孙承宗作为首辅，迅速冷静下来，分析道，“奢崇明蓄谋已久，骤然发难，川省官军恐难抵挡。成都若失，则全川震动，甚至可能波及云贵！必须立刻派兵平叛！”
军事内阁的应急机制立刻启动。众人围在西南舆图前，紧张地商议起来。
“四川巡抚朱燮元仍在成都，” 袁可立指着地图上的成都位置，“当务之急，是令朱燮元不惜一切代价，坚守待援！同时，应令蜀王朱至澍，开放王府库藏，支援城防，动员城内青壮协助守城！”
“光守不够，必须派精锐入川平叛！” 熊廷弼语气坚决，“只是，各军尚未来得及修整，兵力也未补充，登莱新军还要组建海军……眼下能快速调动的机动兵力……着实有限......”
所有人的目光，不约而同地投向了秦良玉和她麾下刚刚经历血战、损失较少的新军一旅，以及她的根基——白杆兵。
秦良玉感受到众人的目光，毫不犹豫，上前一步，单膝跪地，声音清越而坚定：“陛下！诸位大人！臣世受国恩，岂容逆贼猖獗！臣请旨，愿率本部白杆兵和新军一旅，即刻南下，入川平叛！同时，臣也已接到家书，臣之子马祥麟，接陛下先前密旨，已在石柱整训白杆兵，严阵以待！可令其即刻出兵，驰援成都，里应外合，必破贼军！”
朱常洛看着秦良玉，眼中满是信任和感激。他在征调秦良玉入京之前，就已经秘密指示锦衣卫指挥使骆思恭亲自替马千乘解除冤屈，杀掉了冤枉他的太监丘乘云，并秘密联系了马祥麟取得了马祥麟的谅解。（注：历史上马千乘1613年因得罪监税太监丘乘云被诬陷入狱，秦良玉多方求救无门，最终他于1613年病死在狱中，想一想秦良玉能够在丈夫被冤死的情况下，依旧坚持对大明的忠诚，实在是难能可贵。）
“好！” 朱常洛霍然起身，“秦爱卿忠勇可嘉，朕心甚慰！就依此议！”
他当即口述，由内阁中书舍人记录，军事内阁成员完善，迅速形成决议并下达命令：
“一，八百里加急传谕四川巡抚朱燮元，授其全权，固守成都，以待援军！蜀王朱至澍需全力配合，若有延误，严惩不贷！成都失，则蜀王消！”
“二，敕令石柱宣慰使马祥麟，即刻率领已整训之白杆兵，火速驰援成都，打通道路，护卫省城！”
“三，任命蓟州侯、军事内阁大臣秦良玉为‘平蜀大将军’，总督四川平叛军务！率新军一旅并准其沿途调集湖广等地可用官军，星夜兼程，入川讨逆！”
“四，命兵部、户部、大明皇家商行，全力保障秦良玉部粮草军械供应，沿途州县不得有任何延误！”
命令一道道发出，如同精准的齿轮开始咬合转动。
秦良玉领旨后，甚至来不及更换朝服，便直奔京郊新军一旅驻地。此刻的新军一旅，虽经蓟州苦战，伤亡不小，但骨干尚存，且补充了一批新兵和装备，士气高昂。听闻即将随同他们敬仰的秦帅南下平叛，更是群情激奋。
“将士们！” 秦良玉站在点将台上，声音穿透校场，“西南逆贼奢崇明作乱，荼毒乡里，围攻省城！陛下有旨，命我等即刻入川平叛！此去，山高路远，贼势猖獗，尔等可敢随本帅，再建新功，扬我大明军威？！”
“愿随秦帅！平定叛乱！大明万胜！” 震天的吼声响彻云霄。
没有丝毫耽搁，新军一旅迅速开拔，带着尚未完全平复的征尘，踏上了南下的征程。火炮、粮秣在“大明皇家商行”的高效组织下，通过漕运和陆路，源源不断地向前线输送。
与此同时，数匹快马也带着皇帝的密令和秦良玉的家书，以最快的速度奔向川东石柱。
马祥麟接到命令后，立刻点齐早已摩拳擦掌的白杆兵，誓师出征，如同一条白色的蛟龙，出石柱，直扑被叛军威胁的成都。
一场由军事内阁主导的、针对西南叛乱的快速打击，迅速展开。朱常洛站在皇城上，遥望南方，心中笃定。他相信，有秦良玉这位百战名将，有经过战火洗礼的新军，有忠诚敢战的白杆兵，更有如今高效运转的军事指挥体系，平定奢崇明之乱，只是时间问题。这也将是对新成立的军事内阁和正在推行军改的大明新军，又一次重要的考验和锤炼。