南宋时期，清风镇本是个宁静祥和的地方，百姓们日出而作，日落而息，过着平淡而安稳的日子。然而，最近镇上却来了一位神秘的巫婆，自称能通神灵，可驱邪避灾、祈福求祥。
这巫婆身着奇装异服，脸上涂着厚厚的白粉，嘴唇涂得鲜红如血，眼神中透着一股诡异的光。她在镇中心搭起了一座高台，每日定时在高台上作法，口中念念有词，手中挥舞着奇形怪状的法器，周围还燃烧着散发着刺鼻气味的香火。
一开始，镇上的百姓们只是好奇地围观，并不相信她的话。但巫婆使了个诡计，她暗中在镇上几个孩子身上下了蛊。没过几天，这几个孩子突然同时发病，面色苍白，浑身无力，还时不时地抽搐。孩子的家长们心急如焚，四处求医问药，却都不见好转。
就在这时，巫婆趁机站出来说：“这是神灵降下的惩罚，因为镇上有人做了不敬神灵之事。只有我作法祈求神灵原谅，再让每家每户都拿出钱财来供奉神灵，孩子们的病才能好。”百姓们救子心切，又别无他法，只好纷纷拿出家中的积蓄，按照巫婆的要求去做。
济公云游至此，刚一进镇，就察觉到了镇上弥漫着一股诡异的气息。他看到百姓们一个个愁眉苦脸，神色慌张，便拉住一位老汉问道：“阿弥陀佛，老施主，这镇上究竟发生了何事，为何大家都如此忧愁？”
老汉长叹一声，将事情的来龙去脉一五一十地告诉了济公。济公听后，心中明白这定是那巫婆在作祟。他决定要揭开巫婆的真面目，拯救镇上的百姓。
济公来到巫婆作法的高台前，双手合十，笑眯眯地说：“阿弥陀佛，这位施主，你自称能通神灵，可贫僧看你身上妖气甚重，恐怕是个妖邪在作怪吧。”
巫婆听了，脸色一变，但很快又恢复了镇定，她冷笑一声说：“哪来的疯和尚，竟敢在这里胡言乱语，坏我好事！我可是神灵派来的使者，你敢质疑我，小心神灵降罪于你。”
济公却不恼，依旧笑着说：“施主，出家人不打诳语。你若真是神灵的使者，那就让贫僧考考你。我问你，神灵居住在何处？”巫婆愣了一下，随即胡乱说道：“神灵居住在九霄云外，凡人岂能知晓。”
济公摇了摇头说：“非也非也。神灵本就在人们心中，心存善念，便是与神灵相通。你连这都不懂，还敢自称通神灵？”巫婆被济公问得哑口无言，但她仍不甘心，又耍起赖来：“你这和尚，休要在这里逞口舌之快。有本事你就把孩子们的病治好，否则就别在这里捣乱。”
济公笑着说：“这有何难。不过，在治孩子们的病之前，贫僧要先让你现出原形。”说着，济公从怀里掏出一个破碗，口中念念有词，然后将破碗往空中一抛。只见那破碗瞬间变得巨大无比，散发着金色的光芒，向巫婆罩去。
巫婆见状，惊恐万分，她想逃跑，却发现自己的身体被一股无形的力量束缚住了，动弹不得。破碗将她罩住后，里面传来阵阵惨叫和黑烟。过了一会儿，黑烟散去，破碗变回原来的大小，落回济公手中。而巫婆却变成了一只丑陋的大蜘蛛，躺在地上不停地挣扎。
百姓们看到这一幕，都惊呆了。他们这才明白，原来这个所谓的巫婆是个妖怪变的。济公走上前去，对着大蜘蛛说：“你这妖邪，不在深山修炼，却跑来人间祸害百姓，今日贫僧就饶你不得。”说着，济公举起手中的破蒲扇，轻轻一扇，大蜘蛛便化作了一团黑烟，消失得无影无踪。
接着，济公来到患病孩子们的家中。他从怀里掏出一些草药，让家长们熬成汤药给孩子们喝下。没过多久，孩子们的病情就有了明显的好转，脸色逐渐红润起来，精神也好了许多。
百姓们对济公感激不已，纷纷围上来，要感谢他的救命之恩。济公笑着说：“阿弥陀佛，诸位施主不必客气。出家人以慈悲为怀，惩恶扬善是贫僧的本分。希望大家以后能擦亮眼睛，不要被这些妖邪所迷惑。”
从那以后，清风镇又恢复了往日的宁静与祥和。百姓们更加团结友爱，互帮互助。而济公巧破妖蛊惑案的故事，也在镇上传颂开来，成为了人们口中激励后人的佳话，时刻提醒着人们要相信科学，远离迷信。