他们巧妙设局，故意透露假的治疗方案，引那贵妃上钩。待其露出马脚，再将证据呈给皇上。皇上大怒，严惩了贵妃。皇后病愈后，对苏瑶和李轩感激不尽，赏赐众多。苏瑶和李轩婉拒大部分赏赐，只求皇上允许他们平安返回医馆。自此之后，医馆在宫中也有了名气，来求医的达官贵人更多起来，但他们始终坚守初心，平等对待每一位患者。然而，平静的日子并未持续太久。那位被贬的贵妃家族并不甘心就此失势，暗中买通了一伙江湖恶徒。一天夜里，这伙人潜入医馆，企图放火烧死苏瑶和李轩。幸得一位曾被他们救治过的侠士路过发觉，侠士击退恶徒并告知二人危险来源。苏瑶和李轩明白必须彻底解决后患。于是他们进宫面见皇上，将贵妃家族的恶行和盘托出，并呈上收集的证据。皇上知晓后龙颜震怒，下令抄斩贵妃家族。经此一役，苏瑶和李轩更是声名远扬。各地百姓听闻他们不仅医术高明而且不畏权贵，纷纷前来投靠学医或者求医。苏瑶和李轩决定扩大医馆规模，广收学徒。他们教导学徒们要以仁心济世，不可攀附权贵，更不能畏惧强权。医馆日益兴旺发达，成为当地人人敬仰之处，而苏瑶和李轩的故事也世代流传下来。随着医馆越发兴盛，苏瑶和李轩却未曾懈怠。一日，一位神秘老者带着重病的孙女前来求医。这小女孩所患病症极为罕见，诸多学徒皆束手无策。苏瑶亲自诊治，尝试各种方法，几日后终于找到医治之法。
老者感恩涕零，原来他竟是退隐多年的神医。他惊叹于苏瑶和李轩的医德医术，决定留下传授一些失传的医方和独特的诊疗技巧。在神医的帮助下，医馆的学徒们技艺大增。
不久后，邻国发生疫病。苏瑶和李轩心怀大义，带领部分优秀学徒前往救助。他们运用所学知识，结合神医所传技法，成功控制住疫病。邻国国王大为赞赏，赠予无数珍宝，苏瑶和李轩再次婉拒，只希望两国能互通医学经验。回国后，他们将异国的医疗理念融入医馆教学，培养出更多优秀的医者，让仁心济世的精神传播得更远更广，医馆也一直繁荣下去，造福更多百姓。数年后，医馆已发展成一方大善之地，学徒遍布各地行医救人。然而树大招风，一个名为玄医教的组织悄然盯上了他们。玄医教打着治病救人的幌子，实则行骗敛财。苏瑶和李轩的医馆影响了他们的利益。
玄医教先是派人混入医馆，散播谣言，污蔑医馆用药不当。一些不明真相的民众开始动摇。苏瑶和李轩镇定应对，拿出详细的药材记录和病例反驳。玄医教一计不成又生一计，派人伪装成病人家属闹事。
但苏瑶和李轩多年积累的口碑也不是轻易能撼动的。许多受过恩的百姓站出来维护医馆。这时，那位曾被救助的侠士再度现身。他深入玄医教内部探查，获取了玄医教骗人的铁证。苏瑶和李轩将证据公布于世，玄医教声誉扫地。
经此风波，医馆更加坚如磐石。苏瑶和李轩继续传承医术与仁德，他们的名字永远镌刻在百姓心中，成为医者仁心的典范，受后人永世敬仰。