南宋年间，江南有一座繁华的城镇，名为锦绣城。城内街道纵横交错，店铺鳞次栉比，百姓们安居乐业，一派祥和之景。然而，一场突如其来的瘟疫却如恶魔般降临，打破了这份宁静与美好。
起初，只是有几个人出现了发热、咳嗽、浑身乏力的症状，大家都以为只是普通的伤风感冒，并未在意。可没过多久，患病的人越来越多，病情也越来越严重，不少人甚至在短短几天内就失去了生命。一时间，锦绣城笼罩在一片恐惧之中，街道上冷冷清清，店铺纷纷关门歇业，百姓们足不出户，生怕被传染上瘟疫。
城中的大夫们虽然竭尽全力救治病人，但面对这场来势汹汹的瘟疫，他们也束手无策。常用的汤药对瘟疫毫无效果，许多大夫自己也不幸染病身亡。城中的富商们为了自保，纷纷带着家眷逃离了锦绣城，只留下那些贫苦的百姓在城中苦苦挣扎。
就在大家都感到绝望的时候，一个消息传来：济公活佛云游到了附近。百姓们仿佛看到了黑暗中的一丝曙光，他们纷纷派出代表，四处寻找济公，希望能得到他的救助。
此时，济公正悠闲地坐在城外一座破庙的门槛上，啃着半个发硬的馒头。他的破衣烂衫在微风中轻轻飘动，手中的破蒲扇有一下没一下地扇着，嘴里还哼着不成调的小曲。当听到百姓们的哭诉后，济公那原本眯着的眼睛突然睁大，眼中闪过一丝睿智的光芒，他站起身来，拍了拍身上的灰尘，说：“大家莫急，贫僧这就随你们进城看看。”
济公走进锦绣城，眼前的景象让他眉头紧锁。街道上弥漫着一股刺鼻的腐臭味，时不时能看到有人倒在路边，奄奄一息。他来到城中的医馆，看到大夫们一个个愁眉苦脸，病床上躺满了痛苦呻吟的病人。济公仔细地观察了病人的症状，又询问了大夫们之前用药的情况，然后闭上眼睛，陷入了沉思。
过了一会儿，济公睁开眼睛，对大夫们说：“这瘟疫乃是由城中污水积聚、蚊虫滋生，再加上天气湿热，瘴气弥漫所致。要治愈这瘟疫，需用几种特殊的草药配制成汤药，让病人服用，同时还要清理城中的污水，消灭蚊虫，改善环境。”
大夫们听了，将信将疑。其中一位年长的大夫说：“活佛，我们之前也试过不少草药，都没有效果，您说的那几种草药真的能治好瘟疫吗？”济公笑着说：“医者，当信而敢为。这几种草药看似普通，但若配伍得当，便能发挥奇效。你们不妨一试。”
于是，大夫们按照济公提供的药方，四处采集草药。可其中有一种名为“灵仙草”的药材十分稀少，只在城外一座陡峭的山峰上才有。这座山峰云雾缭绕，山势险峻，而且山上还有许多毒蛇猛兽，采集起来非常危险。
济公得知这个情况后，二话不说，拿起一个竹篓，就朝着山峰走去。百姓们担心他的安危，纷纷劝阻，但济公却笑着说：“救人一命，胜造七级浮屠。为了大家的健康，贫僧就算冒点险也值得。”
经过一番艰难的攀爬，济公终于在山峰的悬崖边找到了灵仙草。他小心翼翼地将草药采摘下来，放进竹篓里，然后顺着山壁小心翼翼地下来。当他回到城中时，身上已经满是伤痕，但他却毫不在意，只是笑着说：“草药采回来了，大家赶紧熬药吧。”
大夫们将采集来的草药按照济公的药方精心熬制，然后将汤药分发给病人服用。奇迹出现了，那些服用了汤药的病人，病情逐渐好转，没过几天就康复了。百姓们欢呼雀跃，对济公感激不已。
与此同时，济公还组织百姓们清理城中的污水，在各个角落撒上驱蚊虫的药粉。经过一段时间的努力，锦绣城的环境得到了极大的改善，蚊虫也少了很多。
随着最后一位病人康复出院，锦绣城的瘟疫终于被彻底消灭了。城中又恢复了往日的热闹景象，街道上人来人往，店铺重新开张，百姓们的脸上又露出了幸福的笑容。
为了感谢济公的救命之恩，百姓们自发地为济公修建了一座庙宇，将他供奉起来。而济公却笑着说：“贫僧云游四方，只为救苦救难，不需要这些供奉。”说完，他又摇着破蒲扇，哼着小曲，继续他的云游之旅去了。从此，济公巧治瘟疫、妙手救苍生的故事在锦绣城乃至整个江南地区流传开来，成为了人们口中永恒的传奇。